Protein–RNA interactions for Protein: Q9UP95

SLC12A4, Solute carrier family 12 member 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A4Q9UP95 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms