Protein–RNA interactions for Protein: Q9UD57

NKX1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-2Q9UD57 STK3-201ENST00000419617 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NKX1-2Q9UD57 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NKX1-2Q9UD57 ACSM2A-209ENST00000573854 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NKX1-2Q9UD57 OPRL1-203ENST00000355631 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NKX1-2Q9UD57 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NKX1-2Q9UD57 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
NKX1-2Q9UD57 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NKX1-2Q9UD57 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NKX1-2Q9UD57 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NKX1-2Q9UD57 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NKX1-2Q9UD57 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NKX1-2Q9UD57 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NKX1-2Q9UD57 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NKX1-2Q9UD57 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NKX1-2Q9UD57 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NKX1-2Q9UD57 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NKX1-2Q9UD57 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NKX1-2Q9UD57 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NKX1-2Q9UD57 EP400NL-206ENST00000446190 3697 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NKX1-2Q9UD57 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NKX1-2Q9UD57 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NKX1-2Q9UD57 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NKX1-2Q9UD57 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NKX1-2Q9UD57 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NKX1-2Q9UD57 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NKX1-2Q9UD57 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NKX1-2Q9UD57 PCDHB3-201ENST00000231130 3355 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NKX1-2Q9UD57 AP4B1-201ENST00000256658 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NKX1-2Q9UD57 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NKX1-2Q9UD57 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NKX1-2Q9UD57 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NKX1-2Q9UD57 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NKX1-2Q9UD57 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NKX1-2Q9UD57 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NKX1-2Q9UD57 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NKX1-2Q9UD57 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NKX1-2Q9UD57 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NKX1-2Q9UD57 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NKX1-2Q9UD57 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NKX1-2Q9UD57 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NKX1-2Q9UD57 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NKX1-2Q9UD57 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
NKX1-2Q9UD57 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NKX1-2Q9UD57 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
NKX1-2Q9UD57 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NKX1-2Q9UD57 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NKX1-2Q9UD57 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NKX1-2Q9UD57 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NKX1-2Q9UD57 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NKX1-2Q9UD57 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NKX1-2Q9UD57 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NKX1-2Q9UD57 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NKX1-2Q9UD57 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NKX1-2Q9UD57 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
NKX1-2Q9UD57 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NKX1-2Q9UD57 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NKX1-2Q9UD57 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NKX1-2Q9UD57 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NKX1-2Q9UD57 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NKX1-2Q9UD57 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NKX1-2Q9UD57 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NKX1-2Q9UD57 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NKX1-2Q9UD57 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NKX1-2Q9UD57 ABLIM2-213ENST00000514025 2974 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NKX1-2Q9UD57 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NKX1-2Q9UD57 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NKX1-2Q9UD57 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NKX1-2Q9UD57 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NKX1-2Q9UD57 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NKX1-2Q9UD57 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NKX1-2Q9UD57 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NKX1-2Q9UD57 LINC01782-201ENST00000591212 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NKX1-2Q9UD57 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NKX1-2Q9UD57 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NKX1-2Q9UD57 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NKX1-2Q9UD57 PPP5D1-201ENST00000414155 1882 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NKX1-2Q9UD57 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NKX1-2Q9UD57 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NKX1-2Q9UD57 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NKX1-2Q9UD57 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
NKX1-2Q9UD57 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NKX1-2Q9UD57 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NKX1-2Q9UD57 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NKX1-2Q9UD57 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NKX1-2Q9UD57 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NKX1-2Q9UD57 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
NKX1-2Q9UD57 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NKX1-2Q9UD57 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NKX1-2Q9UD57 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NKX1-2Q9UD57 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NKX1-2Q9UD57 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NKX1-2Q9UD57 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NKX1-2Q9UD57 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
NKX1-2Q9UD57 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NKX1-2Q9UD57 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NKX1-2Q9UD57 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NKX1-2Q9UD57 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
NKX1-2Q9UD57 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NKX1-2Q9UD57 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
NKX1-2Q9UD57 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms