Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBY8

CLN8, Protein CLN8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8Q9UBY8 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CLN8Q9UBY8 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CLN8Q9UBY8 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CLN8Q9UBY8 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CLN8Q9UBY8 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CLN8Q9UBY8 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CLN8Q9UBY8 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CLN8Q9UBY8 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CLN8Q9UBY8 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CLN8Q9UBY8 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CLN8Q9UBY8 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CLN8Q9UBY8 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CLN8Q9UBY8 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CLN8Q9UBY8 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CLN8Q9UBY8 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CLN8Q9UBY8 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CLN8Q9UBY8 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CLN8Q9UBY8 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CLN8Q9UBY8 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CLN8Q9UBY8 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CLN8Q9UBY8 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CLN8Q9UBY8 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CLN8Q9UBY8 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CLN8Q9UBY8 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CLN8Q9UBY8 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CLN8Q9UBY8 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CLN8Q9UBY8 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CLN8Q9UBY8 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CLN8Q9UBY8 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CLN8Q9UBY8 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CLN8Q9UBY8 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CLN8Q9UBY8 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CLN8Q9UBY8 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CLN8Q9UBY8 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CLN8Q9UBY8 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CLN8Q9UBY8 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CLN8Q9UBY8 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CLN8Q9UBY8 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CLN8Q9UBY8 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CLN8Q9UBY8 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
CLN8Q9UBY8 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
CLN8Q9UBY8 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
CLN8Q9UBY8 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
CLN8Q9UBY8 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
CLN8Q9UBY8 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CLN8Q9UBY8 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CLN8Q9UBY8 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CLN8Q9UBY8 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CLN8Q9UBY8 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CLN8Q9UBY8 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CLN8Q9UBY8 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CLN8Q9UBY8 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CLN8Q9UBY8 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CLN8Q9UBY8 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CLN8Q9UBY8 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CLN8Q9UBY8 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CLN8Q9UBY8 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CLN8Q9UBY8 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CLN8Q9UBY8 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CLN8Q9UBY8 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CLN8Q9UBY8 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CLN8Q9UBY8 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CLN8Q9UBY8 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CLN8Q9UBY8 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CLN8Q9UBY8 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CLN8Q9UBY8 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CLN8Q9UBY8 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CLN8Q9UBY8 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CLN8Q9UBY8 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CLN8Q9UBY8 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CLN8Q9UBY8 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CLN8Q9UBY8 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CLN8Q9UBY8 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CLN8Q9UBY8 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CLN8Q9UBY8 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CLN8Q9UBY8 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CLN8Q9UBY8 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CLN8Q9UBY8 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CLN8Q9UBY8 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CLN8Q9UBY8 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CLN8Q9UBY8 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CLN8Q9UBY8 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CLN8Q9UBY8 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CLN8Q9UBY8 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CLN8Q9UBY8 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CLN8Q9UBY8 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CLN8Q9UBY8 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CLN8Q9UBY8 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CLN8Q9UBY8 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CLN8Q9UBY8 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CLN8Q9UBY8 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CLN8Q9UBY8 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CLN8Q9UBY8 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CLN8Q9UBY8 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CLN8Q9UBY8 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CLN8Q9UBY8 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CLN8Q9UBY8 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CLN8Q9UBY8 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CLN8Q9UBY8 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CLN8Q9UBY8 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
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