Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT3

DKK4, Dickkopf-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK4Q9UBT3 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
DKK4Q9UBT3 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
DKK4Q9UBT3 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
DKK4Q9UBT3 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
DKK4Q9UBT3 AC026904.3-201ENST00000636550 1530 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
DKK4Q9UBT3 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
DKK4Q9UBT3 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DKK4Q9UBT3 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DKK4Q9UBT3 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
DKK4Q9UBT3 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
DKK4Q9UBT3 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DKK4Q9UBT3 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DKK4Q9UBT3 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DKK4Q9UBT3 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DKK4Q9UBT3 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DKK4Q9UBT3 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
DKK4Q9UBT3 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DKK4Q9UBT3 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DKK4Q9UBT3 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
DKK4Q9UBT3 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
DKK4Q9UBT3 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DKK4Q9UBT3 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DKK4Q9UBT3 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
DKK4Q9UBT3 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DKK4Q9UBT3 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
DKK4Q9UBT3 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
DKK4Q9UBT3 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
DKK4Q9UBT3 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
DKK4Q9UBT3 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
DKK4Q9UBT3 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
DKK4Q9UBT3 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
DKK4Q9UBT3 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
DKK4Q9UBT3 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
DKK4Q9UBT3 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
DKK4Q9UBT3 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
DKK4Q9UBT3 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
DKK4Q9UBT3 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DKK4Q9UBT3 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
DKK4Q9UBT3 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
DKK4Q9UBT3 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DKK4Q9UBT3 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DKK4Q9UBT3 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DKK4Q9UBT3 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
DKK4Q9UBT3 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
DKK4Q9UBT3 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DKK4Q9UBT3 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DKK4Q9UBT3 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DKK4Q9UBT3 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DKK4Q9UBT3 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DKK4Q9UBT3 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DKK4Q9UBT3 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DKK4Q9UBT3 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DKK4Q9UBT3 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DKK4Q9UBT3 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DKK4Q9UBT3 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DKK4Q9UBT3 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DKK4Q9UBT3 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DKK4Q9UBT3 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DKK4Q9UBT3 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DKK4Q9UBT3 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DKK4Q9UBT3 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DKK4Q9UBT3 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DKK4Q9UBT3 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DKK4Q9UBT3 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DKK4Q9UBT3 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DKK4Q9UBT3 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DKK4Q9UBT3 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
DKK4Q9UBT3 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DKK4Q9UBT3 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
DKK4Q9UBT3 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
DKK4Q9UBT3 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DKK4Q9UBT3 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
DKK4Q9UBT3 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
DKK4Q9UBT3 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
DKK4Q9UBT3 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DKK4Q9UBT3 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DKK4Q9UBT3 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DKK4Q9UBT3 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DKK4Q9UBT3 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DKK4Q9UBT3 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DKK4Q9UBT3 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DKK4Q9UBT3 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DKK4Q9UBT3 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DKK4Q9UBT3 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DKK4Q9UBT3 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DKK4Q9UBT3 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DKK4Q9UBT3 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DKK4Q9UBT3 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DKK4Q9UBT3 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DKK4Q9UBT3 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DKK4Q9UBT3 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DKK4Q9UBT3 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DKK4Q9UBT3 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DKK4Q9UBT3 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DKK4Q9UBT3 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
DKK4Q9UBT3 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DKK4Q9UBT3 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DKK4Q9UBT3 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
DKK4Q9UBT3 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DKK4Q9UBT3 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 146.7 ms