Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBR1

UPB1, Beta-ureidopropionase, humanhuman

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Length 384 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPB1Q9UBR1 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
UPB1Q9UBR1 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
UPB1Q9UBR1 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
UPB1Q9UBR1 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
UPB1Q9UBR1 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
UPB1Q9UBR1 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
UPB1Q9UBR1 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
UPB1Q9UBR1 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
UPB1Q9UBR1 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
UPB1Q9UBR1 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
UPB1Q9UBR1 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
UPB1Q9UBR1 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
UPB1Q9UBR1 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
UPB1Q9UBR1 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
UPB1Q9UBR1 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
UPB1Q9UBR1 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
UPB1Q9UBR1 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
UPB1Q9UBR1 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
UPB1Q9UBR1 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
UPB1Q9UBR1 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
UPB1Q9UBR1 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
UPB1Q9UBR1 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
UPB1Q9UBR1 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
UPB1Q9UBR1 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
UPB1Q9UBR1 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
UPB1Q9UBR1 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
UPB1Q9UBR1 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
UPB1Q9UBR1 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
UPB1Q9UBR1 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
UPB1Q9UBR1 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
UPB1Q9UBR1 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
UPB1Q9UBR1 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
UPB1Q9UBR1 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
UPB1Q9UBR1 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
UPB1Q9UBR1 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
UPB1Q9UBR1 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
UPB1Q9UBR1 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
UPB1Q9UBR1 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
UPB1Q9UBR1 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
UPB1Q9UBR1 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
UPB1Q9UBR1 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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UPB1Q9UBR1 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
UPB1Q9UBR1 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
UPB1Q9UBR1 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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UPB1Q9UBR1 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
UPB1Q9UBR1 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
UPB1Q9UBR1 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
UPB1Q9UBR1 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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UPB1Q9UBR1 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
UPB1Q9UBR1 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
UPB1Q9UBR1 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
UPB1Q9UBR1 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
UPB1Q9UBR1 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
UPB1Q9UBR1 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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UPB1Q9UBR1 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
UPB1Q9UBR1 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
UPB1Q9UBR1 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
UPB1Q9UBR1 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
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UPB1Q9UBR1 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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UPB1Q9UBR1 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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UPB1Q9UBR1 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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UPB1Q9UBR1 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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UPB1Q9UBR1 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
UPB1Q9UBR1 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
UPB1Q9UBR1 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
UPB1Q9UBR1 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
UPB1Q9UBR1 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
UPB1Q9UBR1 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
UPB1Q9UBR1 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
UPB1Q9UBR1 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
UPB1Q9UBR1 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
UPB1Q9UBR1 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
UPB1Q9UBR1 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
UPB1Q9UBR1 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
UPB1Q9UBR1 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
UPB1Q9UBR1 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
UPB1Q9UBR1 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
UPB1Q9UBR1 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
UPB1Q9UBR1 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
UPB1Q9UBR1 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
UPB1Q9UBR1 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
UPB1Q9UBR1 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
UPB1Q9UBR1 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
UPB1Q9UBR1 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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