Protein–RNA interactions for Protein: Q9P219

CCDC88C, Protein Daple, humanhuman

Predictions only

Length 2,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC88CQ9P219 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC88CQ9P219 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC88CQ9P219 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC88CQ9P219 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC88CQ9P219 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC88CQ9P219 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC88CQ9P219 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC88CQ9P219 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC88CQ9P219 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC88CQ9P219 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC88CQ9P219 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC88CQ9P219 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC88CQ9P219 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC88CQ9P219 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC88CQ9P219 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC88CQ9P219 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC88CQ9P219 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC88CQ9P219 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC88CQ9P219 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC88CQ9P219 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC88CQ9P219 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC88CQ9P219 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC88CQ9P219 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC88CQ9P219 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC88CQ9P219 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC88CQ9P219 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC88CQ9P219 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC88CQ9P219 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC88CQ9P219 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC88CQ9P219 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC88CQ9P219 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC88CQ9P219 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC88CQ9P219 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC88CQ9P219 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC88CQ9P219 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC88CQ9P219 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC88CQ9P219 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC88CQ9P219 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC88CQ9P219 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC88CQ9P219 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC88CQ9P219 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC88CQ9P219 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC88CQ9P219 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC88CQ9P219 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC88CQ9P219 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC88CQ9P219 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC88CQ9P219 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC88CQ9P219 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC88CQ9P219 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC88CQ9P219 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC88CQ9P219 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC88CQ9P219 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC88CQ9P219 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC88CQ9P219 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC88CQ9P219 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC88CQ9P219 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC88CQ9P219 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC88CQ9P219 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC88CQ9P219 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC88CQ9P219 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC88CQ9P219 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC88CQ9P219 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC88CQ9P219 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC88CQ9P219 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC88CQ9P219 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC88CQ9P219 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC88CQ9P219 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC88CQ9P219 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC88CQ9P219 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC88CQ9P219 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC88CQ9P219 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC88CQ9P219 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC88CQ9P219 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC88CQ9P219 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC88CQ9P219 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC88CQ9P219 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC88CQ9P219 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC88CQ9P219 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC88CQ9P219 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC88CQ9P219 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC88CQ9P219 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC88CQ9P219 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC88CQ9P219 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC88CQ9P219 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC88CQ9P219 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC88CQ9P219 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC88CQ9P219 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC88CQ9P219 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC88CQ9P219 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC88CQ9P219 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC88CQ9P219 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC88CQ9P219 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC88CQ9P219 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC88CQ9P219 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC88CQ9P219 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC88CQ9P219 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC88CQ9P219 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC88CQ9P219 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC88CQ9P219 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC88CQ9P219 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms