Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1U1

ACTR3B, Actin-related protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR3BQ9P1U1 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTR3BQ9P1U1 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTR3BQ9P1U1 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTR3BQ9P1U1 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTR3BQ9P1U1 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTR3BQ9P1U1 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTR3BQ9P1U1 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTR3BQ9P1U1 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTR3BQ9P1U1 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTR3BQ9P1U1 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTR3BQ9P1U1 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTR3BQ9P1U1 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTR3BQ9P1U1 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTR3BQ9P1U1 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTR3BQ9P1U1 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTR3BQ9P1U1 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTR3BQ9P1U1 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTR3BQ9P1U1 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTR3BQ9P1U1 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTR3BQ9P1U1 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTR3BQ9P1U1 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTR3BQ9P1U1 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTR3BQ9P1U1 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTR3BQ9P1U1 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ACTR3BQ9P1U1 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ACTR3BQ9P1U1 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ACTR3BQ9P1U1 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ACTR3BQ9P1U1 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ACTR3BQ9P1U1 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ACTR3BQ9P1U1 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ACTR3BQ9P1U1 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ACTR3BQ9P1U1 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ACTR3BQ9P1U1 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ACTR3BQ9P1U1 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ACTR3BQ9P1U1 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
ACTR3BQ9P1U1 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ACTR3BQ9P1U1 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ACTR3BQ9P1U1 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ACTR3BQ9P1U1 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ACTR3BQ9P1U1 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ACTR3BQ9P1U1 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ACTR3BQ9P1U1 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ACTR3BQ9P1U1 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ACTR3BQ9P1U1 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ACTR3BQ9P1U1 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ACTR3BQ9P1U1 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ACTR3BQ9P1U1 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ACTR3BQ9P1U1 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ACTR3BQ9P1U1 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ACTR3BQ9P1U1 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ACTR3BQ9P1U1 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ACTR3BQ9P1U1 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ACTR3BQ9P1U1 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ACTR3BQ9P1U1 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ACTR3BQ9P1U1 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ACTR3BQ9P1U1 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ACTR3BQ9P1U1 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ACTR3BQ9P1U1 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ACTR3BQ9P1U1 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ACTR3BQ9P1U1 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ACTR3BQ9P1U1 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ACTR3BQ9P1U1 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ACTR3BQ9P1U1 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ACTR3BQ9P1U1 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ACTR3BQ9P1U1 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ACTR3BQ9P1U1 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ACTR3BQ9P1U1 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ACTR3BQ9P1U1 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACTR3BQ9P1U1 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACTR3BQ9P1U1 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACTR3BQ9P1U1 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ACTR3BQ9P1U1 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ACTR3BQ9P1U1 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACTR3BQ9P1U1 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACTR3BQ9P1U1 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACTR3BQ9P1U1 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACTR3BQ9P1U1 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACTR3BQ9P1U1 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACTR3BQ9P1U1 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACTR3BQ9P1U1 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACTR3BQ9P1U1 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ACTR3BQ9P1U1 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ACTR3BQ9P1U1 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACTR3BQ9P1U1 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ACTR3BQ9P1U1 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ACTR3BQ9P1U1 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ACTR3BQ9P1U1 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACTR3BQ9P1U1 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ACTR3BQ9P1U1 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ACTR3BQ9P1U1 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ACTR3BQ9P1U1 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ACTR3BQ9P1U1 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ACTR3BQ9P1U1 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ACTR3BQ9P1U1 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ACTR3BQ9P1U1 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACTR3BQ9P1U1 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ACTR3BQ9P1U1 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ACTR3BQ9P1U1 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ACTR3BQ9P1U1 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACTR3BQ9P1U1 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.8 ms