Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SH3BP4Q9P0V3 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SH3BP4Q9P0V3 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SH3BP4Q9P0V3 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SH3BP4Q9P0V3 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SH3BP4Q9P0V3 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SH3BP4Q9P0V3 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SH3BP4Q9P0V3 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SH3BP4Q9P0V3 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SH3BP4Q9P0V3 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SH3BP4Q9P0V3 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SH3BP4Q9P0V3 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SH3BP4Q9P0V3 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SH3BP4Q9P0V3 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SH3BP4Q9P0V3 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SH3BP4Q9P0V3 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SH3BP4Q9P0V3 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SH3BP4Q9P0V3 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SH3BP4Q9P0V3 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SH3BP4Q9P0V3 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SH3BP4Q9P0V3 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SH3BP4Q9P0V3 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SH3BP4Q9P0V3 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SH3BP4Q9P0V3 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SH3BP4Q9P0V3 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SH3BP4Q9P0V3 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SH3BP4Q9P0V3 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SH3BP4Q9P0V3 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SH3BP4Q9P0V3 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SH3BP4Q9P0V3 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SH3BP4Q9P0V3 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SH3BP4Q9P0V3 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SH3BP4Q9P0V3 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SH3BP4Q9P0V3 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SH3BP4Q9P0V3 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SH3BP4Q9P0V3 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SH3BP4Q9P0V3 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SH3BP4Q9P0V3 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SH3BP4Q9P0V3 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SH3BP4Q9P0V3 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SH3BP4Q9P0V3 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SH3BP4Q9P0V3 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SH3BP4Q9P0V3 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SH3BP4Q9P0V3 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SH3BP4Q9P0V3 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SH3BP4Q9P0V3 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SH3BP4Q9P0V3 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SH3BP4Q9P0V3 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SH3BP4Q9P0V3 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SH3BP4Q9P0V3 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SH3BP4Q9P0V3 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SH3BP4Q9P0V3 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SH3BP4Q9P0V3 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SH3BP4Q9P0V3 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SH3BP4Q9P0V3 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SH3BP4Q9P0V3 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SH3BP4Q9P0V3 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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SH3BP4Q9P0V3 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
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SH3BP4Q9P0V3 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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