Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR8

RDH8, Retinol dehydrogenase 8, humanhuman

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Length 311 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH8Q9NYR8 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RDH8Q9NYR8 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RDH8Q9NYR8 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RDH8Q9NYR8 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RDH8Q9NYR8 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RDH8Q9NYR8 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RDH8Q9NYR8 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RDH8Q9NYR8 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RDH8Q9NYR8 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RDH8Q9NYR8 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RDH8Q9NYR8 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RDH8Q9NYR8 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RDH8Q9NYR8 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
RDH8Q9NYR8 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RDH8Q9NYR8 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RDH8Q9NYR8 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RDH8Q9NYR8 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RDH8Q9NYR8 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RDH8Q9NYR8 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RDH8Q9NYR8 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RDH8Q9NYR8 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RDH8Q9NYR8 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RDH8Q9NYR8 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RDH8Q9NYR8 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RDH8Q9NYR8 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RDH8Q9NYR8 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RDH8Q9NYR8 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RDH8Q9NYR8 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RDH8Q9NYR8 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RDH8Q9NYR8 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RDH8Q9NYR8 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RDH8Q9NYR8 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
RDH8Q9NYR8 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RDH8Q9NYR8 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RDH8Q9NYR8 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RDH8Q9NYR8 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RDH8Q9NYR8 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RDH8Q9NYR8 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RDH8Q9NYR8 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RDH8Q9NYR8 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RDH8Q9NYR8 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RDH8Q9NYR8 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RDH8Q9NYR8 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RDH8Q9NYR8 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RDH8Q9NYR8 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RDH8Q9NYR8 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RDH8Q9NYR8 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RDH8Q9NYR8 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RDH8Q9NYR8 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RDH8Q9NYR8 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RDH8Q9NYR8 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RDH8Q9NYR8 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RDH8Q9NYR8 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RDH8Q9NYR8 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RDH8Q9NYR8 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RDH8Q9NYR8 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RDH8Q9NYR8 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RDH8Q9NYR8 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RDH8Q9NYR8 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RDH8Q9NYR8 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RDH8Q9NYR8 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RDH8Q9NYR8 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RDH8Q9NYR8 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RDH8Q9NYR8 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RDH8Q9NYR8 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RDH8Q9NYR8 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RDH8Q9NYR8 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
RDH8Q9NYR8 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
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RDH8Q9NYR8 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RDH8Q9NYR8 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RDH8Q9NYR8 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RDH8Q9NYR8 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RDH8Q9NYR8 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RDH8Q9NYR8 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RDH8Q9NYR8 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RDH8Q9NYR8 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RDH8Q9NYR8 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RDH8Q9NYR8 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RDH8Q9NYR8 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RDH8Q9NYR8 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RDH8Q9NYR8 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RDH8Q9NYR8 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RDH8Q9NYR8 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RDH8Q9NYR8 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RDH8Q9NYR8 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
RDH8Q9NYR8 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
RDH8Q9NYR8 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RDH8Q9NYR8 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RDH8Q9NYR8 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
RDH8Q9NYR8 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RDH8Q9NYR8 TUBGCP6-201ENST00000248846 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RDH8Q9NYR8 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RDH8Q9NYR8 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RDH8Q9NYR8 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RDH8Q9NYR8 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RDH8Q9NYR8 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RDH8Q9NYR8 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RDH8Q9NYR8 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RDH8Q9NYR8 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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