Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPD5

SLCO1B3, Solute carrier organic anion transporter family member 1B3, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLCO1B3Q9NPD5 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLCO1B3Q9NPD5 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SLCO1B3Q9NPD5 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLCO1B3Q9NPD5 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLCO1B3Q9NPD5 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLCO1B3Q9NPD5 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLCO1B3Q9NPD5 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLCO1B3Q9NPD5 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLCO1B3Q9NPD5 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SLCO1B3Q9NPD5 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLCO1B3Q9NPD5 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLCO1B3Q9NPD5 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLCO1B3Q9NPD5 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLCO1B3Q9NPD5 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLCO1B3Q9NPD5 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLCO1B3Q9NPD5 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLCO1B3Q9NPD5 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SLCO1B3Q9NPD5 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLCO1B3Q9NPD5 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLCO1B3Q9NPD5 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLCO1B3Q9NPD5 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLCO1B3Q9NPD5 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLCO1B3Q9NPD5 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLCO1B3Q9NPD5 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SLCO1B3Q9NPD5 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SLCO1B3Q9NPD5 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLCO1B3Q9NPD5 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SLCO1B3Q9NPD5 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SLCO1B3Q9NPD5 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLCO1B3Q9NPD5 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLCO1B3Q9NPD5 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLCO1B3Q9NPD5 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLCO1B3Q9NPD5 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLCO1B3Q9NPD5 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLCO1B3Q9NPD5 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLCO1B3Q9NPD5 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLCO1B3Q9NPD5 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLCO1B3Q9NPD5 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLCO1B3Q9NPD5 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLCO1B3Q9NPD5 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLCO1B3Q9NPD5 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLCO1B3Q9NPD5 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLCO1B3Q9NPD5 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLCO1B3Q9NPD5 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLCO1B3Q9NPD5 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLCO1B3Q9NPD5 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLCO1B3Q9NPD5 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLCO1B3Q9NPD5 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLCO1B3Q9NPD5 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLCO1B3Q9NPD5 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLCO1B3Q9NPD5 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLCO1B3Q9NPD5 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLCO1B3Q9NPD5 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLCO1B3Q9NPD5 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLCO1B3Q9NPD5 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLCO1B3Q9NPD5 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLCO1B3Q9NPD5 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLCO1B3Q9NPD5 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLCO1B3Q9NPD5 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLCO1B3Q9NPD5 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLCO1B3Q9NPD5 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLCO1B3Q9NPD5 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLCO1B3Q9NPD5 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLCO1B3Q9NPD5 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLCO1B3Q9NPD5 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLCO1B3Q9NPD5 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLCO1B3Q9NPD5 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLCO1B3Q9NPD5 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLCO1B3Q9NPD5 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLCO1B3Q9NPD5 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLCO1B3Q9NPD5 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLCO1B3Q9NPD5 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLCO1B3Q9NPD5 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLCO1B3Q9NPD5 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLCO1B3Q9NPD5 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLCO1B3Q9NPD5 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLCO1B3Q9NPD5 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLCO1B3Q9NPD5 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLCO1B3Q9NPD5 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLCO1B3Q9NPD5 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLCO1B3Q9NPD5 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLCO1B3Q9NPD5 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLCO1B3Q9NPD5 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLCO1B3Q9NPD5 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLCO1B3Q9NPD5 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLCO1B3Q9NPD5 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLCO1B3Q9NPD5 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLCO1B3Q9NPD5 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLCO1B3Q9NPD5 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLCO1B3Q9NPD5 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SLCO1B3Q9NPD5 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SLCO1B3Q9NPD5 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SLCO1B3Q9NPD5 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SLCO1B3Q9NPD5 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SLCO1B3Q9NPD5 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SLCO1B3Q9NPD5 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SLCO1B3Q9NPD5 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SLCO1B3Q9NPD5 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SLCO1B3Q9NPD5 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SLCO1B3Q9NPD5 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms