Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBJ7

USP29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, humanhuman

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Length 922 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP29Q9HBJ7 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP29Q9HBJ7 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP29Q9HBJ7 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP29Q9HBJ7 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
USP29Q9HBJ7 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP29Q9HBJ7 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP29Q9HBJ7 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
USP29Q9HBJ7 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
USP29Q9HBJ7 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP29Q9HBJ7 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP29Q9HBJ7 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP29Q9HBJ7 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP29Q9HBJ7 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP29Q9HBJ7 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP29Q9HBJ7 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP29Q9HBJ7 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
USP29Q9HBJ7 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP29Q9HBJ7 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP29Q9HBJ7 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP29Q9HBJ7 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP29Q9HBJ7 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
USP29Q9HBJ7 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP29Q9HBJ7 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP29Q9HBJ7 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP29Q9HBJ7 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP29Q9HBJ7 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP29Q9HBJ7 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP29Q9HBJ7 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP29Q9HBJ7 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP29Q9HBJ7 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP29Q9HBJ7 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP29Q9HBJ7 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP29Q9HBJ7 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP29Q9HBJ7 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP29Q9HBJ7 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP29Q9HBJ7 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP29Q9HBJ7 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP29Q9HBJ7 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP29Q9HBJ7 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP29Q9HBJ7 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP29Q9HBJ7 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP29Q9HBJ7 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP29Q9HBJ7 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
USP29Q9HBJ7 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP29Q9HBJ7 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP29Q9HBJ7 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP29Q9HBJ7 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP29Q9HBJ7 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP29Q9HBJ7 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
USP29Q9HBJ7 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP29Q9HBJ7 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP29Q9HBJ7 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP29Q9HBJ7 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP29Q9HBJ7 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP29Q9HBJ7 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP29Q9HBJ7 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP29Q9HBJ7 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
USP29Q9HBJ7 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP29Q9HBJ7 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP29Q9HBJ7 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP29Q9HBJ7 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP29Q9HBJ7 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP29Q9HBJ7 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP29Q9HBJ7 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP29Q9HBJ7 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
USP29Q9HBJ7 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
USP29Q9HBJ7 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
USP29Q9HBJ7 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
USP29Q9HBJ7 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
USP29Q9HBJ7 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
USP29Q9HBJ7 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
USP29Q9HBJ7 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
USP29Q9HBJ7 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
USP29Q9HBJ7 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
USP29Q9HBJ7 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
USP29Q9HBJ7 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
USP29Q9HBJ7 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
USP29Q9HBJ7 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
USP29Q9HBJ7 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
USP29Q9HBJ7 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
USP29Q9HBJ7 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
USP29Q9HBJ7 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
USP29Q9HBJ7 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
USP29Q9HBJ7 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
USP29Q9HBJ7 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
USP29Q9HBJ7 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
USP29Q9HBJ7 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
USP29Q9HBJ7 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
USP29Q9HBJ7 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
USP29Q9HBJ7 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
USP29Q9HBJ7 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
USP29Q9HBJ7 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
USP29Q9HBJ7 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
USP29Q9HBJ7 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
USP29Q9HBJ7 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
USP29Q9HBJ7 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
USP29Q9HBJ7 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
USP29Q9HBJ7 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
USP29Q9HBJ7 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
USP29Q9HBJ7 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
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