Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9Z2

LIN28A, Protein lin-28 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN28AQ9H9Z2 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LIN28AQ9H9Z2 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LIN28AQ9H9Z2 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LIN28AQ9H9Z2 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LIN28AQ9H9Z2 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LIN28AQ9H9Z2 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LIN28AQ9H9Z2 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LIN28AQ9H9Z2 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LIN28AQ9H9Z2 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LIN28AQ9H9Z2 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LIN28AQ9H9Z2 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LIN28AQ9H9Z2 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LIN28AQ9H9Z2 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LIN28AQ9H9Z2 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LIN28AQ9H9Z2 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LIN28AQ9H9Z2 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LIN28AQ9H9Z2 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LIN28AQ9H9Z2 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LIN28AQ9H9Z2 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LIN28AQ9H9Z2 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LIN28AQ9H9Z2 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LIN28AQ9H9Z2 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LIN28AQ9H9Z2 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LIN28AQ9H9Z2 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LIN28AQ9H9Z2 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LIN28AQ9H9Z2 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LIN28AQ9H9Z2 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LIN28AQ9H9Z2 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LIN28AQ9H9Z2 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LIN28AQ9H9Z2 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LIN28AQ9H9Z2 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LIN28AQ9H9Z2 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LIN28AQ9H9Z2 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LIN28AQ9H9Z2 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LIN28AQ9H9Z2 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LIN28AQ9H9Z2 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LIN28AQ9H9Z2 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LIN28AQ9H9Z2 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LIN28AQ9H9Z2 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LIN28AQ9H9Z2 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LIN28AQ9H9Z2 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LIN28AQ9H9Z2 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LIN28AQ9H9Z2 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LIN28AQ9H9Z2 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LIN28AQ9H9Z2 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LIN28AQ9H9Z2 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LIN28AQ9H9Z2 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LIN28AQ9H9Z2 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LIN28AQ9H9Z2 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LIN28AQ9H9Z2 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LIN28AQ9H9Z2 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LIN28AQ9H9Z2 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LIN28AQ9H9Z2 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LIN28AQ9H9Z2 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LIN28AQ9H9Z2 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LIN28AQ9H9Z2 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LIN28AQ9H9Z2 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LIN28AQ9H9Z2 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LIN28AQ9H9Z2 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LIN28AQ9H9Z2 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LIN28AQ9H9Z2 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LIN28AQ9H9Z2 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LIN28AQ9H9Z2 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LIN28AQ9H9Z2 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LIN28AQ9H9Z2 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LIN28AQ9H9Z2 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LIN28AQ9H9Z2 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LIN28AQ9H9Z2 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LIN28AQ9H9Z2 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LIN28AQ9H9Z2 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LIN28AQ9H9Z2 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LIN28AQ9H9Z2 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LIN28AQ9H9Z2 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LIN28AQ9H9Z2 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LIN28AQ9H9Z2 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LIN28AQ9H9Z2 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LIN28AQ9H9Z2 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LIN28AQ9H9Z2 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LIN28AQ9H9Z2 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LIN28AQ9H9Z2 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LIN28AQ9H9Z2 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LIN28AQ9H9Z2 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LIN28AQ9H9Z2 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LIN28AQ9H9Z2 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LIN28AQ9H9Z2 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LIN28AQ9H9Z2 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LIN28AQ9H9Z2 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LIN28AQ9H9Z2 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LIN28AQ9H9Z2 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LIN28AQ9H9Z2 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LIN28AQ9H9Z2 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LIN28AQ9H9Z2 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LIN28AQ9H9Z2 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LIN28AQ9H9Z2 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LIN28AQ9H9Z2 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LIN28AQ9H9Z2 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LIN28AQ9H9Z2 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LIN28AQ9H9Z2 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LIN28AQ9H9Z2 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LIN28AQ9H9Z2 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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