Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0H6

KLHL4, Kelch-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL4Q9C0H6 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL4Q9C0H6 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms