Protein–RNA interactions for Protein: Q9C037

TRIM4, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM4, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM4Q9C037 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM4Q9C037 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM4Q9C037 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM4Q9C037 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM4Q9C037 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM4Q9C037 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM4Q9C037 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM4Q9C037 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM4Q9C037 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM4Q9C037 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM4Q9C037 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM4Q9C037 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM4Q9C037 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM4Q9C037 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM4Q9C037 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM4Q9C037 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM4Q9C037 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM4Q9C037 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM4Q9C037 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM4Q9C037 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM4Q9C037 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM4Q9C037 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM4Q9C037 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM4Q9C037 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM4Q9C037 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM4Q9C037 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM4Q9C037 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM4Q9C037 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM4Q9C037 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM4Q9C037 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM4Q9C037 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM4Q9C037 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM4Q9C037 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM4Q9C037 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM4Q9C037 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM4Q9C037 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM4Q9C037 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM4Q9C037 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM4Q9C037 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM4Q9C037 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM4Q9C037 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM4Q9C037 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM4Q9C037 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM4Q9C037 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM4Q9C037 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM4Q9C037 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM4Q9C037 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM4Q9C037 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM4Q9C037 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM4Q9C037 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM4Q9C037 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM4Q9C037 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM4Q9C037 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM4Q9C037 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM4Q9C037 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM4Q9C037 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM4Q9C037 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM4Q9C037 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM4Q9C037 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM4Q9C037 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM4Q9C037 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM4Q9C037 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM4Q9C037 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM4Q9C037 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM4Q9C037 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM4Q9C037 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM4Q9C037 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM4Q9C037 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM4Q9C037 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM4Q9C037 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM4Q9C037 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM4Q9C037 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM4Q9C037 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM4Q9C037 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM4Q9C037 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM4Q9C037 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM4Q9C037 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM4Q9C037 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM4Q9C037 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM4Q9C037 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM4Q9C037 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM4Q9C037 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM4Q9C037 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM4Q9C037 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM4Q9C037 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM4Q9C037 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM4Q9C037 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM4Q9C037 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM4Q9C037 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM4Q9C037 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM4Q9C037 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM4Q9C037 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM4Q9C037 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM4Q9C037 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM4Q9C037 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM4Q9C037 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM4Q9C037 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM4Q9C037 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM4Q9C037 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM4Q9C037 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms