Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZX4

ROPN1B, Ropporin-1B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROPN1BQ9BZX4 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ROPN1BQ9BZX4 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ROPN1BQ9BZX4 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ROPN1BQ9BZX4 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ROPN1BQ9BZX4 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ROPN1BQ9BZX4 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ROPN1BQ9BZX4 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ROPN1BQ9BZX4 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ROPN1BQ9BZX4 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ROPN1BQ9BZX4 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ROPN1BQ9BZX4 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ROPN1BQ9BZX4 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ROPN1BQ9BZX4 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ROPN1BQ9BZX4 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ROPN1BQ9BZX4 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ROPN1BQ9BZX4 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ROPN1BQ9BZX4 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ROPN1BQ9BZX4 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ROPN1BQ9BZX4 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ROPN1BQ9BZX4 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ROPN1BQ9BZX4 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ROPN1BQ9BZX4 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ROPN1BQ9BZX4 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ROPN1BQ9BZX4 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ROPN1BQ9BZX4 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ROPN1BQ9BZX4 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ROPN1BQ9BZX4 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ROPN1BQ9BZX4 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ROPN1BQ9BZX4 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ROPN1BQ9BZX4 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ROPN1BQ9BZX4 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ROPN1BQ9BZX4 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ROPN1BQ9BZX4 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ROPN1BQ9BZX4 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ROPN1BQ9BZX4 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ROPN1BQ9BZX4 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ROPN1BQ9BZX4 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ROPN1BQ9BZX4 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ROPN1BQ9BZX4 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ROPN1BQ9BZX4 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ROPN1BQ9BZX4 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ROPN1BQ9BZX4 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ROPN1BQ9BZX4 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ROPN1BQ9BZX4 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ROPN1BQ9BZX4 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ROPN1BQ9BZX4 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ROPN1BQ9BZX4 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ROPN1BQ9BZX4 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ROPN1BQ9BZX4 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ROPN1BQ9BZX4 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ROPN1BQ9BZX4 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ROPN1BQ9BZX4 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ROPN1BQ9BZX4 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ROPN1BQ9BZX4 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ROPN1BQ9BZX4 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ROPN1BQ9BZX4 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ROPN1BQ9BZX4 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ROPN1BQ9BZX4 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ROPN1BQ9BZX4 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ROPN1BQ9BZX4 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ROPN1BQ9BZX4 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ROPN1BQ9BZX4 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ROPN1BQ9BZX4 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ROPN1BQ9BZX4 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ROPN1BQ9BZX4 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ROPN1BQ9BZX4 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ROPN1BQ9BZX4 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ROPN1BQ9BZX4 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ROPN1BQ9BZX4 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ROPN1BQ9BZX4 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ROPN1BQ9BZX4 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ROPN1BQ9BZX4 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ROPN1BQ9BZX4 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ROPN1BQ9BZX4 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ROPN1BQ9BZX4 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ROPN1BQ9BZX4 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ROPN1BQ9BZX4 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ROPN1BQ9BZX4 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ROPN1BQ9BZX4 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ROPN1BQ9BZX4 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ROPN1BQ9BZX4 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ROPN1BQ9BZX4 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ROPN1BQ9BZX4 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ROPN1BQ9BZX4 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ROPN1BQ9BZX4 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ROPN1BQ9BZX4 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ROPN1BQ9BZX4 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ROPN1BQ9BZX4 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ROPN1BQ9BZX4 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ROPN1BQ9BZX4 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ROPN1BQ9BZX4 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ROPN1BQ9BZX4 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ROPN1BQ9BZX4 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ROPN1BQ9BZX4 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ROPN1BQ9BZX4 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ROPN1BQ9BZX4 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ROPN1BQ9BZX4 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ROPN1BQ9BZX4 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ROPN1BQ9BZX4 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ROPN1BQ9BZX4 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms