Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY41

HDAC8, Histone deacetylase 8, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC8Q9BY41 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HDAC8Q9BY41 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HDAC8Q9BY41 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HDAC8Q9BY41 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HDAC8Q9BY41 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HDAC8Q9BY41 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
HDAC8Q9BY41 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HDAC8Q9BY41 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HDAC8Q9BY41 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HDAC8Q9BY41 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HDAC8Q9BY41 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HDAC8Q9BY41 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HDAC8Q9BY41 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HDAC8Q9BY41 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HDAC8Q9BY41 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HDAC8Q9BY41 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HDAC8Q9BY41 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HDAC8Q9BY41 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HDAC8Q9BY41 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HDAC8Q9BY41 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HDAC8Q9BY41 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HDAC8Q9BY41 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HDAC8Q9BY41 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
HDAC8Q9BY41 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HDAC8Q9BY41 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HDAC8Q9BY41 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HDAC8Q9BY41 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
HDAC8Q9BY41 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HDAC8Q9BY41 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HDAC8Q9BY41 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HDAC8Q9BY41 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HDAC8Q9BY41 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HDAC8Q9BY41 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HDAC8Q9BY41 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HDAC8Q9BY41 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HDAC8Q9BY41 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HDAC8Q9BY41 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HDAC8Q9BY41 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HDAC8Q9BY41 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HDAC8Q9BY41 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDAC8Q9BY41 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDAC8Q9BY41 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDAC8Q9BY41 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDAC8Q9BY41 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDAC8Q9BY41 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDAC8Q9BY41 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDAC8Q9BY41 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDAC8Q9BY41 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDAC8Q9BY41 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HDAC8Q9BY41 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDAC8Q9BY41 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDAC8Q9BY41 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDAC8Q9BY41 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HDAC8Q9BY41 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDAC8Q9BY41 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDAC8Q9BY41 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDAC8Q9BY41 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDAC8Q9BY41 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDAC8Q9BY41 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDAC8Q9BY41 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HDAC8Q9BY41 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDAC8Q9BY41 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDAC8Q9BY41 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HDAC8Q9BY41 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDAC8Q9BY41 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDAC8Q9BY41 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDAC8Q9BY41 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HDAC8Q9BY41 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDAC8Q9BY41 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDAC8Q9BY41 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDAC8Q9BY41 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDAC8Q9BY41 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDAC8Q9BY41 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDAC8Q9BY41 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDAC8Q9BY41 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDAC8Q9BY41 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDAC8Q9BY41 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDAC8Q9BY41 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDAC8Q9BY41 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDAC8Q9BY41 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDAC8Q9BY41 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDAC8Q9BY41 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDAC8Q9BY41 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDAC8Q9BY41 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDAC8Q9BY41 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDAC8Q9BY41 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDAC8Q9BY41 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDAC8Q9BY41 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDAC8Q9BY41 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDAC8Q9BY41 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDAC8Q9BY41 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDAC8Q9BY41 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDAC8Q9BY41 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HDAC8Q9BY41 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HDAC8Q9BY41 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HDAC8Q9BY41 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDAC8Q9BY41 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDAC8Q9BY41 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDAC8Q9BY41 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDAC8Q9BY41 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms