Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXM0

PRX, Periaxin, humanhuman

Predictions only

Length 1,461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRXQ9BXM0 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRXQ9BXM0 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRXQ9BXM0 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRXQ9BXM0 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRXQ9BXM0 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRXQ9BXM0 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRXQ9BXM0 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRXQ9BXM0 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRXQ9BXM0 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRXQ9BXM0 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRXQ9BXM0 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRXQ9BXM0 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRXQ9BXM0 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRXQ9BXM0 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRXQ9BXM0 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRXQ9BXM0 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
PRXQ9BXM0 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRXQ9BXM0 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRXQ9BXM0 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRXQ9BXM0 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRXQ9BXM0 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRXQ9BXM0 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRXQ9BXM0 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRXQ9BXM0 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRXQ9BXM0 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRXQ9BXM0 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PRXQ9BXM0 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PRXQ9BXM0 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRXQ9BXM0 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PRXQ9BXM0 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRXQ9BXM0 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRXQ9BXM0 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRXQ9BXM0 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PRXQ9BXM0 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRXQ9BXM0 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRXQ9BXM0 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRXQ9BXM0 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRXQ9BXM0 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRXQ9BXM0 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRXQ9BXM0 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PRXQ9BXM0 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRXQ9BXM0 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRXQ9BXM0 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRXQ9BXM0 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRXQ9BXM0 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PRXQ9BXM0 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRXQ9BXM0 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRXQ9BXM0 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRXQ9BXM0 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRXQ9BXM0 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRXQ9BXM0 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRXQ9BXM0 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRXQ9BXM0 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRXQ9BXM0 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRXQ9BXM0 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRXQ9BXM0 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRXQ9BXM0 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRXQ9BXM0 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRXQ9BXM0 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRXQ9BXM0 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRXQ9BXM0 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRXQ9BXM0 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRXQ9BXM0 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRXQ9BXM0 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRXQ9BXM0 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRXQ9BXM0 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRXQ9BXM0 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRXQ9BXM0 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRXQ9BXM0 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PRXQ9BXM0 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PRXQ9BXM0 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.64
PRXQ9BXM0 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRXQ9BXM0 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRXQ9BXM0 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRXQ9BXM0 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRXQ9BXM0 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRXQ9BXM0 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRXQ9BXM0 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRXQ9BXM0 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRXQ9BXM0 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRXQ9BXM0 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRXQ9BXM0 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRXQ9BXM0 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PRXQ9BXM0 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PRXQ9BXM0 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRXQ9BXM0 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRXQ9BXM0 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRXQ9BXM0 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRXQ9BXM0 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRXQ9BXM0 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRXQ9BXM0 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRXQ9BXM0 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRXQ9BXM0 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PRXQ9BXM0 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRXQ9BXM0 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRXQ9BXM0 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRXQ9BXM0 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRXQ9BXM0 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PRXQ9BXM0 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PRXQ9BXM0 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms