Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVS4

RIOK2, Serine/threonine-protein kinase RIO2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIOK2Q9BVS4 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RIOK2Q9BVS4 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RIOK2Q9BVS4 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RIOK2Q9BVS4 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RIOK2Q9BVS4 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RIOK2Q9BVS4 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RIOK2Q9BVS4 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RIOK2Q9BVS4 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RIOK2Q9BVS4 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RIOK2Q9BVS4 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RIOK2Q9BVS4 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RIOK2Q9BVS4 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RIOK2Q9BVS4 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RIOK2Q9BVS4 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RIOK2Q9BVS4 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RIOK2Q9BVS4 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RIOK2Q9BVS4 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RIOK2Q9BVS4 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RIOK2Q9BVS4 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RIOK2Q9BVS4 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RIOK2Q9BVS4 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RIOK2Q9BVS4 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RIOK2Q9BVS4 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RIOK2Q9BVS4 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RIOK2Q9BVS4 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RIOK2Q9BVS4 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RIOK2Q9BVS4 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RIOK2Q9BVS4 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RIOK2Q9BVS4 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RIOK2Q9BVS4 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RIOK2Q9BVS4 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RIOK2Q9BVS4 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RIOK2Q9BVS4 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RIOK2Q9BVS4 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RIOK2Q9BVS4 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RIOK2Q9BVS4 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RIOK2Q9BVS4 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RIOK2Q9BVS4 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RIOK2Q9BVS4 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RIOK2Q9BVS4 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RIOK2Q9BVS4 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RIOK2Q9BVS4 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RIOK2Q9BVS4 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RIOK2Q9BVS4 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RIOK2Q9BVS4 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RIOK2Q9BVS4 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RIOK2Q9BVS4 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RIOK2Q9BVS4 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RIOK2Q9BVS4 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RIOK2Q9BVS4 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RIOK2Q9BVS4 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RIOK2Q9BVS4 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RIOK2Q9BVS4 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RIOK2Q9BVS4 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RIOK2Q9BVS4 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RIOK2Q9BVS4 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RIOK2Q9BVS4 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RIOK2Q9BVS4 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RIOK2Q9BVS4 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RIOK2Q9BVS4 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RIOK2Q9BVS4 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RIOK2Q9BVS4 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RIOK2Q9BVS4 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RIOK2Q9BVS4 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RIOK2Q9BVS4 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RIOK2Q9BVS4 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RIOK2Q9BVS4 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RIOK2Q9BVS4 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RIOK2Q9BVS4 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RIOK2Q9BVS4 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RIOK2Q9BVS4 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RIOK2Q9BVS4 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RIOK2Q9BVS4 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RIOK2Q9BVS4 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RIOK2Q9BVS4 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RIOK2Q9BVS4 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RIOK2Q9BVS4 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RIOK2Q9BVS4 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RIOK2Q9BVS4 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RIOK2Q9BVS4 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RIOK2Q9BVS4 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RIOK2Q9BVS4 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RIOK2Q9BVS4 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RIOK2Q9BVS4 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RIOK2Q9BVS4 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RIOK2Q9BVS4 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RIOK2Q9BVS4 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
RIOK2Q9BVS4 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.13
RIOK2Q9BVS4 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
RIOK2Q9BVS4 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RIOK2Q9BVS4 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
RIOK2Q9BVS4 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
RIOK2Q9BVS4 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
RIOK2Q9BVS4 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RIOK2Q9BVS4 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RIOK2Q9BVS4 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RIOK2Q9BVS4 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RIOK2Q9BVS4 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RIOK2Q9BVS4 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RIOK2Q9BVS4 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms