Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA0

KATNB1, Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1, humanhuman

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Length 655 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KATNB1Q9BVA0 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
KATNB1Q9BVA0 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
KATNB1Q9BVA0 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
KATNB1Q9BVA0 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
KATNB1Q9BVA0 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
KATNB1Q9BVA0 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
KATNB1Q9BVA0 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
KATNB1Q9BVA0 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
KATNB1Q9BVA0 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
KATNB1Q9BVA0 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
KATNB1Q9BVA0 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
KATNB1Q9BVA0 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
KATNB1Q9BVA0 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
KATNB1Q9BVA0 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
KATNB1Q9BVA0 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
KATNB1Q9BVA0 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
KATNB1Q9BVA0 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
KATNB1Q9BVA0 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
KATNB1Q9BVA0 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
KATNB1Q9BVA0 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
KATNB1Q9BVA0 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
KATNB1Q9BVA0 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
KATNB1Q9BVA0 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
KATNB1Q9BVA0 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
KATNB1Q9BVA0 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
KATNB1Q9BVA0 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
KATNB1Q9BVA0 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
KATNB1Q9BVA0 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
KATNB1Q9BVA0 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
KATNB1Q9BVA0 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
KATNB1Q9BVA0 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
KATNB1Q9BVA0 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
KATNB1Q9BVA0 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
KATNB1Q9BVA0 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
KATNB1Q9BVA0 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
KATNB1Q9BVA0 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
KATNB1Q9BVA0 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
KATNB1Q9BVA0 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
KATNB1Q9BVA0 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
KATNB1Q9BVA0 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
KATNB1Q9BVA0 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
KATNB1Q9BVA0 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
KATNB1Q9BVA0 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
KATNB1Q9BVA0 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
KATNB1Q9BVA0 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
KATNB1Q9BVA0 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
KATNB1Q9BVA0 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
KATNB1Q9BVA0 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
KATNB1Q9BVA0 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
KATNB1Q9BVA0 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
KATNB1Q9BVA0 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
KATNB1Q9BVA0 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
KATNB1Q9BVA0 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
KATNB1Q9BVA0 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
KATNB1Q9BVA0 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
KATNB1Q9BVA0 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
KATNB1Q9BVA0 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
KATNB1Q9BVA0 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
KATNB1Q9BVA0 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
KATNB1Q9BVA0 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
KATNB1Q9BVA0 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
KATNB1Q9BVA0 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
KATNB1Q9BVA0 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
KATNB1Q9BVA0 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
KATNB1Q9BVA0 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
KATNB1Q9BVA0 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
KATNB1Q9BVA0 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
KATNB1Q9BVA0 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
KATNB1Q9BVA0 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
KATNB1Q9BVA0 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
KATNB1Q9BVA0 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KATNB1Q9BVA0 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KATNB1Q9BVA0 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KATNB1Q9BVA0 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KATNB1Q9BVA0 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
KATNB1Q9BVA0 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
KATNB1Q9BVA0 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KATNB1Q9BVA0 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KATNB1Q9BVA0 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KATNB1Q9BVA0 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KATNB1Q9BVA0 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KATNB1Q9BVA0 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KATNB1Q9BVA0 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
KATNB1Q9BVA0 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KATNB1Q9BVA0 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KATNB1Q9BVA0 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KATNB1Q9BVA0 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KATNB1Q9BVA0 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KATNB1Q9BVA0 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KATNB1Q9BVA0 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KATNB1Q9BVA0 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
KATNB1Q9BVA0 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KATNB1Q9BVA0 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
KATNB1Q9BVA0 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KATNB1Q9BVA0 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KATNB1Q9BVA0 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KATNB1Q9BVA0 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
KATNB1Q9BVA0 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
KATNB1Q9BVA0 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KATNB1Q9BVA0 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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