Protein–RNA interactions for Protein: Q9BST9

RTKN, Rhotekin, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTKNQ9BST9 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RTKNQ9BST9 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RTKNQ9BST9 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RTKNQ9BST9 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
RTKNQ9BST9 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RTKNQ9BST9 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RTKNQ9BST9 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RTKNQ9BST9 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RTKNQ9BST9 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RTKNQ9BST9 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RTKNQ9BST9 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RTKNQ9BST9 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
RTKNQ9BST9 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RTKNQ9BST9 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RTKNQ9BST9 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RTKNQ9BST9 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RTKNQ9BST9 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RTKNQ9BST9 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RTKNQ9BST9 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RTKNQ9BST9 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RTKNQ9BST9 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RTKNQ9BST9 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RTKNQ9BST9 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RTKNQ9BST9 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RTKNQ9BST9 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RTKNQ9BST9 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RTKNQ9BST9 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RTKNQ9BST9 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RTKNQ9BST9 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
RTKNQ9BST9 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RTKNQ9BST9 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RTKNQ9BST9 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RTKNQ9BST9 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RTKNQ9BST9 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RTKNQ9BST9 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RTKNQ9BST9 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RTKNQ9BST9 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RTKNQ9BST9 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RTKNQ9BST9 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
RTKNQ9BST9 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RTKNQ9BST9 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RTKNQ9BST9 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RTKNQ9BST9 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RTKNQ9BST9 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RTKNQ9BST9 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RTKNQ9BST9 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RTKNQ9BST9 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RTKNQ9BST9 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RTKNQ9BST9 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RTKNQ9BST9 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RTKNQ9BST9 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RTKNQ9BST9 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RTKNQ9BST9 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RTKNQ9BST9 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RTKNQ9BST9 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RTKNQ9BST9 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RTKNQ9BST9 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RTKNQ9BST9 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RTKNQ9BST9 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RTKNQ9BST9 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RTKNQ9BST9 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RTKNQ9BST9 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RTKNQ9BST9 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
RTKNQ9BST9 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
RTKNQ9BST9 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
RTKNQ9BST9 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
RTKNQ9BST9 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
RTKNQ9BST9 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
RTKNQ9BST9 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC16.39■□□□□ 0.22
RTKNQ9BST9 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
RTKNQ9BST9 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
RTKNQ9BST9 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
RTKNQ9BST9 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RTKNQ9BST9 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RTKNQ9BST9 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RTKNQ9BST9 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RTKNQ9BST9 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RTKNQ9BST9 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RTKNQ9BST9 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RTKNQ9BST9 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RTKNQ9BST9 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RTKNQ9BST9 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RTKNQ9BST9 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
RTKNQ9BST9 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RTKNQ9BST9 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RTKNQ9BST9 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RTKNQ9BST9 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RTKNQ9BST9 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
RTKNQ9BST9 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RTKNQ9BST9 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RTKNQ9BST9 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RTKNQ9BST9 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RTKNQ9BST9 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RTKNQ9BST9 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RTKNQ9BST9 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RTKNQ9BST9 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RTKNQ9BST9 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RTKNQ9BST9 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RTKNQ9BST9 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RTKNQ9BST9 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms