Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQP7

MGME1, Mitochondrial genome maintenance exonuclease 1, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MGME1Q9BQP7 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MGME1Q9BQP7 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MGME1Q9BQP7 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MGME1Q9BQP7 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MGME1Q9BQP7 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MGME1Q9BQP7 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MGME1Q9BQP7 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MGME1Q9BQP7 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MGME1Q9BQP7 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MGME1Q9BQP7 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MGME1Q9BQP7 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MGME1Q9BQP7 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MGME1Q9BQP7 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MGME1Q9BQP7 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MGME1Q9BQP7 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MGME1Q9BQP7 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MGME1Q9BQP7 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MGME1Q9BQP7 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MGME1Q9BQP7 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MGME1Q9BQP7 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MGME1Q9BQP7 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MGME1Q9BQP7 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MGME1Q9BQP7 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MGME1Q9BQP7 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MGME1Q9BQP7 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MGME1Q9BQP7 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MGME1Q9BQP7 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MGME1Q9BQP7 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MGME1Q9BQP7 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MGME1Q9BQP7 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MGME1Q9BQP7 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MGME1Q9BQP7 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MGME1Q9BQP7 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MGME1Q9BQP7 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MGME1Q9BQP7 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MGME1Q9BQP7 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MGME1Q9BQP7 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MGME1Q9BQP7 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MGME1Q9BQP7 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MGME1Q9BQP7 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MGME1Q9BQP7 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MGME1Q9BQP7 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MGME1Q9BQP7 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MGME1Q9BQP7 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MGME1Q9BQP7 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MGME1Q9BQP7 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MGME1Q9BQP7 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MGME1Q9BQP7 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MGME1Q9BQP7 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MGME1Q9BQP7 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MGME1Q9BQP7 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MGME1Q9BQP7 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
MGME1Q9BQP7 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MGME1Q9BQP7 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MGME1Q9BQP7 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MGME1Q9BQP7 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MGME1Q9BQP7 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MGME1Q9BQP7 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MGME1Q9BQP7 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MGME1Q9BQP7 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MGME1Q9BQP7 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MGME1Q9BQP7 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MGME1Q9BQP7 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MGME1Q9BQP7 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MGME1Q9BQP7 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MGME1Q9BQP7 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MGME1Q9BQP7 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
MGME1Q9BQP7 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MGME1Q9BQP7 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MGME1Q9BQP7 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
MGME1Q9BQP7 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MGME1Q9BQP7 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MGME1Q9BQP7 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MGME1Q9BQP7 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MGME1Q9BQP7 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MGME1Q9BQP7 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
MGME1Q9BQP7 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MGME1Q9BQP7 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MGME1Q9BQP7 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MGME1Q9BQP7 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MGME1Q9BQP7 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MGME1Q9BQP7 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MGME1Q9BQP7 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MGME1Q9BQP7 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MGME1Q9BQP7 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MGME1Q9BQP7 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MGME1Q9BQP7 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MGME1Q9BQP7 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MGME1Q9BQP7 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MGME1Q9BQP7 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MGME1Q9BQP7 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MGME1Q9BQP7 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MGME1Q9BQP7 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MGME1Q9BQP7 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MGME1Q9BQP7 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MGME1Q9BQP7 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MGME1Q9BQP7 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MGME1Q9BQP7 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
MGME1Q9BQP7 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MGME1Q9BQP7 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms