Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQL6

FERMT1, Fermitin family homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FERMT1Q9BQL6 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FERMT1Q9BQL6 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FERMT1Q9BQL6 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FERMT1Q9BQL6 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FERMT1Q9BQL6 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FERMT1Q9BQL6 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FERMT1Q9BQL6 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FERMT1Q9BQL6 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FERMT1Q9BQL6 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FERMT1Q9BQL6 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FERMT1Q9BQL6 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FERMT1Q9BQL6 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FERMT1Q9BQL6 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FERMT1Q9BQL6 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FERMT1Q9BQL6 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FERMT1Q9BQL6 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FERMT1Q9BQL6 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FERMT1Q9BQL6 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FERMT1Q9BQL6 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FERMT1Q9BQL6 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FERMT1Q9BQL6 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FERMT1Q9BQL6 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FERMT1Q9BQL6 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FERMT1Q9BQL6 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FERMT1Q9BQL6 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FERMT1Q9BQL6 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
FERMT1Q9BQL6 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FERMT1Q9BQL6 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FERMT1Q9BQL6 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
FERMT1Q9BQL6 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
FERMT1Q9BQL6 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
FERMT1Q9BQL6 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
FERMT1Q9BQL6 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
FERMT1Q9BQL6 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
FERMT1Q9BQL6 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
FERMT1Q9BQL6 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
FERMT1Q9BQL6 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
FERMT1Q9BQL6 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
FERMT1Q9BQL6 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
FERMT1Q9BQL6 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FERMT1Q9BQL6 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FERMT1Q9BQL6 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FERMT1Q9BQL6 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FERMT1Q9BQL6 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FERMT1Q9BQL6 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FERMT1Q9BQL6 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FERMT1Q9BQL6 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FERMT1Q9BQL6 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
FERMT1Q9BQL6 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
FERMT1Q9BQL6 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FERMT1Q9BQL6 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FERMT1Q9BQL6 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FERMT1Q9BQL6 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
FERMT1Q9BQL6 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
FERMT1Q9BQL6 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FERMT1Q9BQL6 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
FERMT1Q9BQL6 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FERMT1Q9BQL6 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FERMT1Q9BQL6 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FERMT1Q9BQL6 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FERMT1Q9BQL6 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FERMT1Q9BQL6 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FERMT1Q9BQL6 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FERMT1Q9BQL6 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FERMT1Q9BQL6 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FERMT1Q9BQL6 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FERMT1Q9BQL6 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FERMT1Q9BQL6 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FERMT1Q9BQL6 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FERMT1Q9BQL6 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FERMT1Q9BQL6 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FERMT1Q9BQL6 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FERMT1Q9BQL6 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FERMT1Q9BQL6 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FERMT1Q9BQL6 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FERMT1Q9BQL6 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FERMT1Q9BQL6 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FERMT1Q9BQL6 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FERMT1Q9BQL6 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FERMT1Q9BQL6 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FERMT1Q9BQL6 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FERMT1Q9BQL6 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FERMT1Q9BQL6 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FERMT1Q9BQL6 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FERMT1Q9BQL6 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FERMT1Q9BQL6 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FERMT1Q9BQL6 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FERMT1Q9BQL6 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FERMT1Q9BQL6 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FERMT1Q9BQL6 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FERMT1Q9BQL6 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FERMT1Q9BQL6 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FERMT1Q9BQL6 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FERMT1Q9BQL6 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FERMT1Q9BQL6 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FERMT1Q9BQL6 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FERMT1Q9BQL6 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FERMT1Q9BQL6 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FERMT1Q9BQL6 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FERMT1Q9BQL6 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms