Protein–RNA interactions for Protein: Q96DX4

RSPRY1, RING finger and SPRY domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPRY1Q96DX4 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RSPRY1Q96DX4 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RSPRY1Q96DX4 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RSPRY1Q96DX4 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RSPRY1Q96DX4 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RSPRY1Q96DX4 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
RSPRY1Q96DX4 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RSPRY1Q96DX4 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RSPRY1Q96DX4 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RSPRY1Q96DX4 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RSPRY1Q96DX4 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RSPRY1Q96DX4 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RSPRY1Q96DX4 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
RSPRY1Q96DX4 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RSPRY1Q96DX4 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RSPRY1Q96DX4 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RSPRY1Q96DX4 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RSPRY1Q96DX4 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RSPRY1Q96DX4 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RSPRY1Q96DX4 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RSPRY1Q96DX4 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RSPRY1Q96DX4 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RSPRY1Q96DX4 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RSPRY1Q96DX4 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RSPRY1Q96DX4 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RSPRY1Q96DX4 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RSPRY1Q96DX4 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RSPRY1Q96DX4 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RSPRY1Q96DX4 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
RSPRY1Q96DX4 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RSPRY1Q96DX4 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RSPRY1Q96DX4 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RSPRY1Q96DX4 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RSPRY1Q96DX4 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RSPRY1Q96DX4 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
RSPRY1Q96DX4 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
RSPRY1Q96DX4 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RSPRY1Q96DX4 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RSPRY1Q96DX4 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RSPRY1Q96DX4 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RSPRY1Q96DX4 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RSPRY1Q96DX4 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RSPRY1Q96DX4 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RSPRY1Q96DX4 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RSPRY1Q96DX4 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RSPRY1Q96DX4 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RSPRY1Q96DX4 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RSPRY1Q96DX4 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RSPRY1Q96DX4 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RSPRY1Q96DX4 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RSPRY1Q96DX4 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RSPRY1Q96DX4 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RSPRY1Q96DX4 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RSPRY1Q96DX4 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
RSPRY1Q96DX4 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RSPRY1Q96DX4 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RSPRY1Q96DX4 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
RSPRY1Q96DX4 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RSPRY1Q96DX4 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RSPRY1Q96DX4 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
RSPRY1Q96DX4 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RSPRY1Q96DX4 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RSPRY1Q96DX4 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RSPRY1Q96DX4 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
RSPRY1Q96DX4 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
RSPRY1Q96DX4 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RSPRY1Q96DX4 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
RSPRY1Q96DX4 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
RSPRY1Q96DX4 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RSPRY1Q96DX4 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RSPRY1Q96DX4 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RSPRY1Q96DX4 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RSPRY1Q96DX4 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RSPRY1Q96DX4 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RSPRY1Q96DX4 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RSPRY1Q96DX4 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RSPRY1Q96DX4 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RSPRY1Q96DX4 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RSPRY1Q96DX4 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RSPRY1Q96DX4 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RSPRY1Q96DX4 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RSPRY1Q96DX4 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RSPRY1Q96DX4 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RSPRY1Q96DX4 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RSPRY1Q96DX4 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RSPRY1Q96DX4 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RSPRY1Q96DX4 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RSPRY1Q96DX4 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RSPRY1Q96DX4 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RSPRY1Q96DX4 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RSPRY1Q96DX4 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RSPRY1Q96DX4 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
RSPRY1Q96DX4 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RSPRY1Q96DX4 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RSPRY1Q96DX4 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RSPRY1Q96DX4 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RSPRY1Q96DX4 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RSPRY1Q96DX4 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RSPRY1Q96DX4 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RSPRY1Q96DX4 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms