Protein–RNA interactions for Protein: Q92859

NEO1, Neogenin, humanhuman

Predictions only

Length 1,461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEO1Q92859 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NEO1Q92859 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NEO1Q92859 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NEO1Q92859 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NEO1Q92859 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
NEO1Q92859 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NEO1Q92859 FANCA-205ENST00000543736 1000 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NEO1Q92859 LINC01629-201ENST00000553613 581 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NEO1Q92859 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NEO1Q92859 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
NEO1Q92859 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NEO1Q92859 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NEO1Q92859 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NEO1Q92859 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NEO1Q92859 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NEO1Q92859 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NEO1Q92859 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NEO1Q92859 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NEO1Q92859 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NEO1Q92859 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
NEO1Q92859 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NEO1Q92859 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NEO1Q92859 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NEO1Q92859 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
NEO1Q92859 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
NEO1Q92859 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
NEO1Q92859 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
NEO1Q92859 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
NEO1Q92859 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NEO1Q92859 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NEO1Q92859 CNR1-201ENST00000362094 1252 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NEO1Q92859 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
NEO1Q92859 RN7SL818P-201ENST00000485099 259 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
NEO1Q92859 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NEO1Q92859 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
NEO1Q92859 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
NEO1Q92859 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NEO1Q92859 RN7SL725P-201ENST00000606439 259 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
NEO1Q92859 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
NEO1Q92859 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NEO1Q92859 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NEO1Q92859 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NEO1Q92859 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NEO1Q92859 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NEO1Q92859 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NEO1Q92859 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NEO1Q92859 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NEO1Q92859 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NEO1Q92859 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NEO1Q92859 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEO1Q92859 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEO1Q92859 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEO1Q92859 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEO1Q92859 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEO1Q92859 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEO1Q92859 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEO1Q92859 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEO1Q92859 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEO1Q92859 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEO1Q92859 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEO1Q92859 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEO1Q92859 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEO1Q92859 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
NEO1Q92859 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEO1Q92859 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
NEO1Q92859 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
NEO1Q92859 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEO1Q92859 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEO1Q92859 CTBP2P4-201ENST00000513884 920 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
NEO1Q92859 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEO1Q92859 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEO1Q92859 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEO1Q92859 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEO1Q92859 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEO1Q92859 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEO1Q92859 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEO1Q92859 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEO1Q92859 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEO1Q92859 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEO1Q92859 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
NEO1Q92859 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEO1Q92859 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEO1Q92859 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEO1Q92859 SAP30L-203ENST00000440364 792 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEO1Q92859 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEO1Q92859 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
NEO1Q92859 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEO1Q92859 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEO1Q92859 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEO1Q92859 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEO1Q92859 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEO1Q92859 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEO1Q92859 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
NEO1Q92859 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEO1Q92859 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEO1Q92859 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEO1Q92859 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEO1Q92859 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEO1Q92859 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEO1Q92859 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms