Protein–RNA interactions for Protein: Q92750

TAF4B, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF4BQ92750 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TAF4BQ92750 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TAF4BQ92750 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TAF4BQ92750 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TAF4BQ92750 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TAF4BQ92750 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TAF4BQ92750 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TAF4BQ92750 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TAF4BQ92750 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TAF4BQ92750 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TAF4BQ92750 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TAF4BQ92750 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TAF4BQ92750 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TAF4BQ92750 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TAF4BQ92750 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TAF4BQ92750 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TAF4BQ92750 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TAF4BQ92750 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TAF4BQ92750 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TAF4BQ92750 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TAF4BQ92750 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TAF4BQ92750 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TAF4BQ92750 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TAF4BQ92750 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
TAF4BQ92750 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TAF4BQ92750 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TAF4BQ92750 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TAF4BQ92750 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TAF4BQ92750 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TAF4BQ92750 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TAF4BQ92750 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TAF4BQ92750 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TAF4BQ92750 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TAF4BQ92750 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TAF4BQ92750 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TAF4BQ92750 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TAF4BQ92750 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TAF4BQ92750 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TAF4BQ92750 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TAF4BQ92750 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TAF4BQ92750 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TAF4BQ92750 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TAF4BQ92750 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TAF4BQ92750 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TAF4BQ92750 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TAF4BQ92750 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TAF4BQ92750 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TAF4BQ92750 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TAF4BQ92750 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TAF4BQ92750 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TAF4BQ92750 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TAF4BQ92750 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TAF4BQ92750 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TAF4BQ92750 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
TAF4BQ92750 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TAF4BQ92750 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
TAF4BQ92750 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TAF4BQ92750 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TAF4BQ92750 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TAF4BQ92750 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TAF4BQ92750 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TAF4BQ92750 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TAF4BQ92750 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TAF4BQ92750 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TAF4BQ92750 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TAF4BQ92750 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TAF4BQ92750 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TAF4BQ92750 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TAF4BQ92750 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TAF4BQ92750 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
TAF4BQ92750 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TAF4BQ92750 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TAF4BQ92750 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TAF4BQ92750 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TAF4BQ92750 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TAF4BQ92750 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TAF4BQ92750 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
TAF4BQ92750 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
TAF4BQ92750 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TAF4BQ92750 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TAF4BQ92750 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TAF4BQ92750 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TAF4BQ92750 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TAF4BQ92750 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
TAF4BQ92750 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
TAF4BQ92750 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TAF4BQ92750 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TAF4BQ92750 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TAF4BQ92750 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TAF4BQ92750 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TAF4BQ92750 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TAF4BQ92750 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TAF4BQ92750 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TAF4BQ92750 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TAF4BQ92750 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TAF4BQ92750 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TAF4BQ92750 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TAF4BQ92750 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TAF4BQ92750 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
TAF4BQ92750 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms