Protein–RNA interactions for Protein: Q92696

RABGGTA, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 567 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTAQ92696 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RABGGTAQ92696 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RABGGTAQ92696 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RABGGTAQ92696 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RABGGTAQ92696 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RABGGTAQ92696 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RABGGTAQ92696 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RABGGTAQ92696 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RABGGTAQ92696 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RABGGTAQ92696 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RABGGTAQ92696 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RABGGTAQ92696 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RABGGTAQ92696 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RABGGTAQ92696 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RABGGTAQ92696 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RABGGTAQ92696 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RABGGTAQ92696 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RABGGTAQ92696 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
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RABGGTAQ92696 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
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RABGGTAQ92696 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RABGGTAQ92696 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RABGGTAQ92696 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RABGGTAQ92696 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RABGGTAQ92696 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RABGGTAQ92696 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RABGGTAQ92696 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RABGGTAQ92696 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RABGGTAQ92696 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RABGGTAQ92696 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RABGGTAQ92696 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RABGGTAQ92696 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RABGGTAQ92696 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RABGGTAQ92696 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RABGGTAQ92696 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RABGGTAQ92696 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
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RABGGTAQ92696 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RABGGTAQ92696 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RABGGTAQ92696 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RABGGTAQ92696 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RABGGTAQ92696 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
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RABGGTAQ92696 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RABGGTAQ92696 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RABGGTAQ92696 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RABGGTAQ92696 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
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RABGGTAQ92696 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
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RABGGTAQ92696 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
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RABGGTAQ92696 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
RABGGTAQ92696 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RABGGTAQ92696 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RABGGTAQ92696 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
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RABGGTAQ92696 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RABGGTAQ92696 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RABGGTAQ92696 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RABGGTAQ92696 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
RABGGTAQ92696 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RABGGTAQ92696 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RABGGTAQ92696 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RABGGTAQ92696 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RABGGTAQ92696 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RABGGTAQ92696 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RABGGTAQ92696 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RABGGTAQ92696 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RABGGTAQ92696 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RABGGTAQ92696 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RABGGTAQ92696 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RABGGTAQ92696 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RABGGTAQ92696 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
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