Protein–RNA interactions for Protein: Q8WYN3

CSRNP3, Cysteine/serine-rich nuclear protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRNP3Q8WYN3 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CSRNP3Q8WYN3 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CSRNP3Q8WYN3 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CSRNP3Q8WYN3 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CSRNP3Q8WYN3 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CSRNP3Q8WYN3 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CSRNP3Q8WYN3 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CSRNP3Q8WYN3 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CSRNP3Q8WYN3 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CSRNP3Q8WYN3 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CSRNP3Q8WYN3 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CSRNP3Q8WYN3 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CSRNP3Q8WYN3 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CSRNP3Q8WYN3 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CSRNP3Q8WYN3 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CSRNP3Q8WYN3 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CSRNP3Q8WYN3 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CSRNP3Q8WYN3 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CSRNP3Q8WYN3 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CSRNP3Q8WYN3 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CSRNP3Q8WYN3 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CSRNP3Q8WYN3 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CSRNP3Q8WYN3 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CSRNP3Q8WYN3 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CSRNP3Q8WYN3 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CSRNP3Q8WYN3 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CSRNP3Q8WYN3 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CSRNP3Q8WYN3 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
CSRNP3Q8WYN3 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.72
CSRNP3Q8WYN3 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CSRNP3Q8WYN3 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CSRNP3Q8WYN3 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CSRNP3Q8WYN3 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CSRNP3Q8WYN3 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CSRNP3Q8WYN3 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CSRNP3Q8WYN3 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CSRNP3Q8WYN3 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CSRNP3Q8WYN3 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CSRNP3Q8WYN3 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CSRNP3Q8WYN3 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CSRNP3Q8WYN3 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CSRNP3Q8WYN3 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CSRNP3Q8WYN3 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CSRNP3Q8WYN3 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CSRNP3Q8WYN3 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CSRNP3Q8WYN3 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CSRNP3Q8WYN3 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CSRNP3Q8WYN3 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CSRNP3Q8WYN3 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CSRNP3Q8WYN3 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CSRNP3Q8WYN3 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CSRNP3Q8WYN3 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CSRNP3Q8WYN3 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CSRNP3Q8WYN3 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CSRNP3Q8WYN3 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CSRNP3Q8WYN3 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CSRNP3Q8WYN3 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CSRNP3Q8WYN3 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CSRNP3Q8WYN3 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CSRNP3Q8WYN3 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CSRNP3Q8WYN3 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CSRNP3Q8WYN3 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CSRNP3Q8WYN3 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CSRNP3Q8WYN3 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CSRNP3Q8WYN3 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CSRNP3Q8WYN3 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CSRNP3Q8WYN3 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CSRNP3Q8WYN3 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CSRNP3Q8WYN3 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CSRNP3Q8WYN3 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CSRNP3Q8WYN3 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CSRNP3Q8WYN3 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CSRNP3Q8WYN3 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CSRNP3Q8WYN3 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CSRNP3Q8WYN3 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CSRNP3Q8WYN3 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CSRNP3Q8WYN3 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CSRNP3Q8WYN3 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CSRNP3Q8WYN3 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CSRNP3Q8WYN3 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CSRNP3Q8WYN3 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CSRNP3Q8WYN3 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CSRNP3Q8WYN3 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CSRNP3Q8WYN3 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CSRNP3Q8WYN3 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CSRNP3Q8WYN3 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CSRNP3Q8WYN3 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CSRNP3Q8WYN3 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CSRNP3Q8WYN3 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CSRNP3Q8WYN3 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CSRNP3Q8WYN3 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CSRNP3Q8WYN3 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CSRNP3Q8WYN3 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CSRNP3Q8WYN3 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CSRNP3Q8WYN3 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CSRNP3Q8WYN3 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CSRNP3Q8WYN3 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CSRNP3Q8WYN3 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CSRNP3Q8WYN3 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CSRNP3Q8WYN3 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms