Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4E4

PDCL2, Phosducin-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCL2Q8N4E4 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PDCL2Q8N4E4 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PDCL2Q8N4E4 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PDCL2Q8N4E4 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PDCL2Q8N4E4 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PDCL2Q8N4E4 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PDCL2Q8N4E4 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PDCL2Q8N4E4 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PDCL2Q8N4E4 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PDCL2Q8N4E4 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PDCL2Q8N4E4 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PDCL2Q8N4E4 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PDCL2Q8N4E4 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PDCL2Q8N4E4 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PDCL2Q8N4E4 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PDCL2Q8N4E4 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PDCL2Q8N4E4 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PDCL2Q8N4E4 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PDCL2Q8N4E4 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PDCL2Q8N4E4 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PDCL2Q8N4E4 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PDCL2Q8N4E4 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PDCL2Q8N4E4 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PDCL2Q8N4E4 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PDCL2Q8N4E4 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PDCL2Q8N4E4 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PDCL2Q8N4E4 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PDCL2Q8N4E4 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PDCL2Q8N4E4 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PDCL2Q8N4E4 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PDCL2Q8N4E4 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PDCL2Q8N4E4 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDCL2Q8N4E4 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDCL2Q8N4E4 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDCL2Q8N4E4 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDCL2Q8N4E4 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDCL2Q8N4E4 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDCL2Q8N4E4 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDCL2Q8N4E4 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDCL2Q8N4E4 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDCL2Q8N4E4 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDCL2Q8N4E4 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDCL2Q8N4E4 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDCL2Q8N4E4 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDCL2Q8N4E4 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PDCL2Q8N4E4 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PDCL2Q8N4E4 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDCL2Q8N4E4 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDCL2Q8N4E4 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDCL2Q8N4E4 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDCL2Q8N4E4 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDCL2Q8N4E4 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDCL2Q8N4E4 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDCL2Q8N4E4 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDCL2Q8N4E4 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDCL2Q8N4E4 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDCL2Q8N4E4 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDCL2Q8N4E4 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDCL2Q8N4E4 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDCL2Q8N4E4 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDCL2Q8N4E4 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDCL2Q8N4E4 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDCL2Q8N4E4 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDCL2Q8N4E4 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDCL2Q8N4E4 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDCL2Q8N4E4 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDCL2Q8N4E4 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDCL2Q8N4E4 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDCL2Q8N4E4 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDCL2Q8N4E4 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDCL2Q8N4E4 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDCL2Q8N4E4 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDCL2Q8N4E4 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDCL2Q8N4E4 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDCL2Q8N4E4 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDCL2Q8N4E4 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDCL2Q8N4E4 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDCL2Q8N4E4 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDCL2Q8N4E4 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDCL2Q8N4E4 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PDCL2Q8N4E4 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PDCL2Q8N4E4 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PDCL2Q8N4E4 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDCL2Q8N4E4 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PDCL2Q8N4E4 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDCL2Q8N4E4 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDCL2Q8N4E4 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDCL2Q8N4E4 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDCL2Q8N4E4 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDCL2Q8N4E4 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDCL2Q8N4E4 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PDCL2Q8N4E4 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDCL2Q8N4E4 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDCL2Q8N4E4 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDCL2Q8N4E4 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDCL2Q8N4E4 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PDCL2Q8N4E4 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDCL2Q8N4E4 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDCL2Q8N4E4 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDCL2Q8N4E4 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms