Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL4

USP43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, humanhuman

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Length 1,123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43Q70EL4 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
USP43Q70EL4 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
USP43Q70EL4 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
USP43Q70EL4 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
USP43Q70EL4 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
USP43Q70EL4 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
USP43Q70EL4 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
USP43Q70EL4 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
USP43Q70EL4 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
USP43Q70EL4 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
USP43Q70EL4 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
USP43Q70EL4 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
USP43Q70EL4 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
USP43Q70EL4 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
USP43Q70EL4 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
USP43Q70EL4 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
USP43Q70EL4 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
USP43Q70EL4 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
USP43Q70EL4 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
USP43Q70EL4 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
USP43Q70EL4 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
USP43Q70EL4 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
USP43Q70EL4 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
USP43Q70EL4 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
USP43Q70EL4 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
USP43Q70EL4 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
USP43Q70EL4 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
USP43Q70EL4 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
USP43Q70EL4 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
USP43Q70EL4 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
USP43Q70EL4 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
USP43Q70EL4 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
USP43Q70EL4 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
USP43Q70EL4 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
USP43Q70EL4 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
USP43Q70EL4 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
USP43Q70EL4 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
USP43Q70EL4 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
USP43Q70EL4 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
USP43Q70EL4 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
USP43Q70EL4 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
USP43Q70EL4 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
USP43Q70EL4 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
USP43Q70EL4 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
USP43Q70EL4 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
USP43Q70EL4 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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USP43Q70EL4 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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USP43Q70EL4 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
USP43Q70EL4 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
USP43Q70EL4 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
USP43Q70EL4 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
USP43Q70EL4 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
USP43Q70EL4 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
USP43Q70EL4 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
USP43Q70EL4 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
USP43Q70EL4 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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USP43Q70EL4 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
USP43Q70EL4 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
USP43Q70EL4 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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USP43Q70EL4 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
USP43Q70EL4 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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USP43Q70EL4 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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USP43Q70EL4 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
USP43Q70EL4 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
USP43Q70EL4 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
USP43Q70EL4 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
USP43Q70EL4 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
USP43Q70EL4 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
USP43Q70EL4 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
USP43Q70EL4 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
USP43Q70EL4 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
USP43Q70EL4 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
USP43Q70EL4 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
USP43Q70EL4 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
USP43Q70EL4 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
USP43Q70EL4 LINC00887-202ENST00000414120 2880 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
USP43Q70EL4 ACKR3-201ENST00000272928 2203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
USP43Q70EL4 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
USP43Q70EL4 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
USP43Q70EL4 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
USP43Q70EL4 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
USP43Q70EL4 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
USP43Q70EL4 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
USP43Q70EL4 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
USP43Q70EL4 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
USP43Q70EL4 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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