Protein–RNA interactions for Protein: Q6RUI8

C19orf48, Uncharacterized protein C19orf48, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C19orf48Q6RUI8 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C19orf48Q6RUI8 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C19orf48Q6RUI8 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C19orf48Q6RUI8 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C19orf48Q6RUI8 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C19orf48Q6RUI8 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C19orf48Q6RUI8 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C19orf48Q6RUI8 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C19orf48Q6RUI8 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C19orf48Q6RUI8 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C19orf48Q6RUI8 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C19orf48Q6RUI8 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C19orf48Q6RUI8 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
C19orf48Q6RUI8 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C19orf48Q6RUI8 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
C19orf48Q6RUI8 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C19orf48Q6RUI8 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C19orf48Q6RUI8 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C19orf48Q6RUI8 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C19orf48Q6RUI8 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C19orf48Q6RUI8 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
C19orf48Q6RUI8 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C19orf48Q6RUI8 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C19orf48Q6RUI8 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C19orf48Q6RUI8 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C19orf48Q6RUI8 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
C19orf48Q6RUI8 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C19orf48Q6RUI8 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C19orf48Q6RUI8 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C19orf48Q6RUI8 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C19orf48Q6RUI8 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C19orf48Q6RUI8 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C19orf48Q6RUI8 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C19orf48Q6RUI8 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C19orf48Q6RUI8 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C19orf48Q6RUI8 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C19orf48Q6RUI8 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C19orf48Q6RUI8 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C19orf48Q6RUI8 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C19orf48Q6RUI8 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
C19orf48Q6RUI8 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C19orf48Q6RUI8 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C19orf48Q6RUI8 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C19orf48Q6RUI8 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C19orf48Q6RUI8 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C19orf48Q6RUI8 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C19orf48Q6RUI8 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C19orf48Q6RUI8 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C19orf48Q6RUI8 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C19orf48Q6RUI8 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C19orf48Q6RUI8 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C19orf48Q6RUI8 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C19orf48Q6RUI8 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C19orf48Q6RUI8 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C19orf48Q6RUI8 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C19orf48Q6RUI8 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C19orf48Q6RUI8 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C19orf48Q6RUI8 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C19orf48Q6RUI8 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C19orf48Q6RUI8 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C19orf48Q6RUI8 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C19orf48Q6RUI8 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C19orf48Q6RUI8 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
C19orf48Q6RUI8 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C19orf48Q6RUI8 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C19orf48Q6RUI8 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C19orf48Q6RUI8 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C19orf48Q6RUI8 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C19orf48Q6RUI8 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C19orf48Q6RUI8 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C19orf48Q6RUI8 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C19orf48Q6RUI8 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C19orf48Q6RUI8 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C19orf48Q6RUI8 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C19orf48Q6RUI8 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C19orf48Q6RUI8 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C19orf48Q6RUI8 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C19orf48Q6RUI8 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C19orf48Q6RUI8 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C19orf48Q6RUI8 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C19orf48Q6RUI8 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C19orf48Q6RUI8 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C19orf48Q6RUI8 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C19orf48Q6RUI8 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C19orf48Q6RUI8 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C19orf48Q6RUI8 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C19orf48Q6RUI8 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C19orf48Q6RUI8 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C19orf48Q6RUI8 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
C19orf48Q6RUI8 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C19orf48Q6RUI8 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C19orf48Q6RUI8 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C19orf48Q6RUI8 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C19orf48Q6RUI8 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C19orf48Q6RUI8 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C19orf48Q6RUI8 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C19orf48Q6RUI8 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C19orf48Q6RUI8 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C19orf48Q6RUI8 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C19orf48Q6RUI8 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms