Protein–RNA interactions for Protein: Q6F5E8

CARMIL2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL2Q6F5E8 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CARMIL2Q6F5E8 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CARMIL2Q6F5E8 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CARMIL2Q6F5E8 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CARMIL2Q6F5E8 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CARMIL2Q6F5E8 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CARMIL2Q6F5E8 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CARMIL2Q6F5E8 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CARMIL2Q6F5E8 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CARMIL2Q6F5E8 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CARMIL2Q6F5E8 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CARMIL2Q6F5E8 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CARMIL2Q6F5E8 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CARMIL2Q6F5E8 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CARMIL2Q6F5E8 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CARMIL2Q6F5E8 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CARMIL2Q6F5E8 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CARMIL2Q6F5E8 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CARMIL2Q6F5E8 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CARMIL2Q6F5E8 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CARMIL2Q6F5E8 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CARMIL2Q6F5E8 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CARMIL2Q6F5E8 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CARMIL2Q6F5E8 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CARMIL2Q6F5E8 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CARMIL2Q6F5E8 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CARMIL2Q6F5E8 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CARMIL2Q6F5E8 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CARMIL2Q6F5E8 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CARMIL2Q6F5E8 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CARMIL2Q6F5E8 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CARMIL2Q6F5E8 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CARMIL2Q6F5E8 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CARMIL2Q6F5E8 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CARMIL2Q6F5E8 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CARMIL2Q6F5E8 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CARMIL2Q6F5E8 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CARMIL2Q6F5E8 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CARMIL2Q6F5E8 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CARMIL2Q6F5E8 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CARMIL2Q6F5E8 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CARMIL2Q6F5E8 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CARMIL2Q6F5E8 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CARMIL2Q6F5E8 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CARMIL2Q6F5E8 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CARMIL2Q6F5E8 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CARMIL2Q6F5E8 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CARMIL2Q6F5E8 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CARMIL2Q6F5E8 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CARMIL2Q6F5E8 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CARMIL2Q6F5E8 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CARMIL2Q6F5E8 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CARMIL2Q6F5E8 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CARMIL2Q6F5E8 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CARMIL2Q6F5E8 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CARMIL2Q6F5E8 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CARMIL2Q6F5E8 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CARMIL2Q6F5E8 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CARMIL2Q6F5E8 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CARMIL2Q6F5E8 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CARMIL2Q6F5E8 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CARMIL2Q6F5E8 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CARMIL2Q6F5E8 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CARMIL2Q6F5E8 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CARMIL2Q6F5E8 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CARMIL2Q6F5E8 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CARMIL2Q6F5E8 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CARMIL2Q6F5E8 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CARMIL2Q6F5E8 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CARMIL2Q6F5E8 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CARMIL2Q6F5E8 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CARMIL2Q6F5E8 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CARMIL2Q6F5E8 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CARMIL2Q6F5E8 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CARMIL2Q6F5E8 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CARMIL2Q6F5E8 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CARMIL2Q6F5E8 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CARMIL2Q6F5E8 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CARMIL2Q6F5E8 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CARMIL2Q6F5E8 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CARMIL2Q6F5E8 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CARMIL2Q6F5E8 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CARMIL2Q6F5E8 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CARMIL2Q6F5E8 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CARMIL2Q6F5E8 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CARMIL2Q6F5E8 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CARMIL2Q6F5E8 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CARMIL2Q6F5E8 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CARMIL2Q6F5E8 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CARMIL2Q6F5E8 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CARMIL2Q6F5E8 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CARMIL2Q6F5E8 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CARMIL2Q6F5E8 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CARMIL2Q6F5E8 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CARMIL2Q6F5E8 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CARMIL2Q6F5E8 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CARMIL2Q6F5E8 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CARMIL2Q6F5E8 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CARMIL2Q6F5E8 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CARMIL2Q6F5E8 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms