Protein–RNA interactions for Protein: Q53EU6

GPAT3, Glycerol-3-phosphate acyltransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 434 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPAT3Q53EU6 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GPAT3Q53EU6 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GPAT3Q53EU6 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GPAT3Q53EU6 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GPAT3Q53EU6 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GPAT3Q53EU6 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GPAT3Q53EU6 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GPAT3Q53EU6 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GPAT3Q53EU6 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GPAT3Q53EU6 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GPAT3Q53EU6 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GPAT3Q53EU6 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GPAT3Q53EU6 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GPAT3Q53EU6 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GPAT3Q53EU6 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GPAT3Q53EU6 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GPAT3Q53EU6 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GPAT3Q53EU6 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GPAT3Q53EU6 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GPAT3Q53EU6 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GPAT3Q53EU6 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GPAT3Q53EU6 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GPAT3Q53EU6 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GPAT3Q53EU6 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GPAT3Q53EU6 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GPAT3Q53EU6 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GPAT3Q53EU6 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GPAT3Q53EU6 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GPAT3Q53EU6 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GPAT3Q53EU6 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GPAT3Q53EU6 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GPAT3Q53EU6 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GPAT3Q53EU6 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GPAT3Q53EU6 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GPAT3Q53EU6 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GPAT3Q53EU6 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GPAT3Q53EU6 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GPAT3Q53EU6 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GPAT3Q53EU6 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GPAT3Q53EU6 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GPAT3Q53EU6 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GPAT3Q53EU6 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GPAT3Q53EU6 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
GPAT3Q53EU6 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GPAT3Q53EU6 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GPAT3Q53EU6 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GPAT3Q53EU6 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GPAT3Q53EU6 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GPAT3Q53EU6 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GPAT3Q53EU6 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GPAT3Q53EU6 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GPAT3Q53EU6 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GPAT3Q53EU6 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GPAT3Q53EU6 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GPAT3Q53EU6 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GPAT3Q53EU6 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GPAT3Q53EU6 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GPAT3Q53EU6 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GPAT3Q53EU6 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GPAT3Q53EU6 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GPAT3Q53EU6 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GPAT3Q53EU6 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GPAT3Q53EU6 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
GPAT3Q53EU6 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GPAT3Q53EU6 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GPAT3Q53EU6 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GPAT3Q53EU6 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GPAT3Q53EU6 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GPAT3Q53EU6 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
GPAT3Q53EU6 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GPAT3Q53EU6 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
GPAT3Q53EU6 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GPAT3Q53EU6 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GPAT3Q53EU6 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GPAT3Q53EU6 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
GPAT3Q53EU6 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GPAT3Q53EU6 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GPAT3Q53EU6 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GPAT3Q53EU6 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GPAT3Q53EU6 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GPAT3Q53EU6 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GPAT3Q53EU6 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GPAT3Q53EU6 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GPAT3Q53EU6 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GPAT3Q53EU6 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GPAT3Q53EU6 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GPAT3Q53EU6 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GPAT3Q53EU6 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GPAT3Q53EU6 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GPAT3Q53EU6 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GPAT3Q53EU6 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GPAT3Q53EU6 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GPAT3Q53EU6 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GPAT3Q53EU6 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
GPAT3Q53EU6 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
GPAT3Q53EU6 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GPAT3Q53EU6 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
GPAT3Q53EU6 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GPAT3Q53EU6 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GPAT3Q53EU6 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms