Protein–RNA interactions for Protein: Q502W7

CCDC38, Coiled-coil domain-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC38Q502W7 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms