Protein–RNA interactions for Protein: Q2VYF4

LETM2, LETM1 domain-containing protein LETM2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETM2Q2VYF4 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LETM2Q2VYF4 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LETM2Q2VYF4 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LETM2Q2VYF4 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LETM2Q2VYF4 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LETM2Q2VYF4 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LETM2Q2VYF4 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LETM2Q2VYF4 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LETM2Q2VYF4 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LETM2Q2VYF4 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LETM2Q2VYF4 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
LETM2Q2VYF4 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LETM2Q2VYF4 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LETM2Q2VYF4 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LETM2Q2VYF4 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LETM2Q2VYF4 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LETM2Q2VYF4 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LETM2Q2VYF4 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LETM2Q2VYF4 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LETM2Q2VYF4 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LETM2Q2VYF4 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LETM2Q2VYF4 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LETM2Q2VYF4 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
LETM2Q2VYF4 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
LETM2Q2VYF4 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LETM2Q2VYF4 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LETM2Q2VYF4 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LETM2Q2VYF4 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LETM2Q2VYF4 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LETM2Q2VYF4 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LETM2Q2VYF4 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LETM2Q2VYF4 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LETM2Q2VYF4 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LETM2Q2VYF4 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LETM2Q2VYF4 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LETM2Q2VYF4 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LETM2Q2VYF4 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LETM2Q2VYF4 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LETM2Q2VYF4 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LETM2Q2VYF4 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LETM2Q2VYF4 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
LETM2Q2VYF4 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
LETM2Q2VYF4 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
LETM2Q2VYF4 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LETM2Q2VYF4 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LETM2Q2VYF4 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
LETM2Q2VYF4 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
LETM2Q2VYF4 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LETM2Q2VYF4 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LETM2Q2VYF4 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LETM2Q2VYF4 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LETM2Q2VYF4 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LETM2Q2VYF4 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LETM2Q2VYF4 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LETM2Q2VYF4 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LETM2Q2VYF4 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LETM2Q2VYF4 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LETM2Q2VYF4 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LETM2Q2VYF4 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LETM2Q2VYF4 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LETM2Q2VYF4 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LETM2Q2VYF4 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LETM2Q2VYF4 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LETM2Q2VYF4 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LETM2Q2VYF4 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LETM2Q2VYF4 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LETM2Q2VYF4 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LETM2Q2VYF4 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LETM2Q2VYF4 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
LETM2Q2VYF4 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LETM2Q2VYF4 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LETM2Q2VYF4 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LETM2Q2VYF4 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LETM2Q2VYF4 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LETM2Q2VYF4 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
LETM2Q2VYF4 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LETM2Q2VYF4 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LETM2Q2VYF4 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
LETM2Q2VYF4 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LETM2Q2VYF4 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LETM2Q2VYF4 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LETM2Q2VYF4 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LETM2Q2VYF4 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LETM2Q2VYF4 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LETM2Q2VYF4 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LETM2Q2VYF4 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LETM2Q2VYF4 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LETM2Q2VYF4 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LETM2Q2VYF4 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LETM2Q2VYF4 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LETM2Q2VYF4 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LETM2Q2VYF4 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LETM2Q2VYF4 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LETM2Q2VYF4 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LETM2Q2VYF4 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LETM2Q2VYF4 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
LETM2Q2VYF4 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LETM2Q2VYF4 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LETM2Q2VYF4 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LETM2Q2VYF4 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
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