Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RTL8BQ17RB0 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
RTL8BQ17RB0 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RTL8BQ17RB0 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RTL8BQ17RB0 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RTL8BQ17RB0 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RTL8BQ17RB0 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RTL8BQ17RB0 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RTL8BQ17RB0 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RTL8BQ17RB0 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RTL8BQ17RB0 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RTL8BQ17RB0 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RTL8BQ17RB0 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RTL8BQ17RB0 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RTL8BQ17RB0 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
RTL8BQ17RB0 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RTL8BQ17RB0 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RTL8BQ17RB0 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RTL8BQ17RB0 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RTL8BQ17RB0 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RTL8BQ17RB0 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RTL8BQ17RB0 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RTL8BQ17RB0 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
RTL8BQ17RB0 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RTL8BQ17RB0 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RTL8BQ17RB0 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RTL8BQ17RB0 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RTL8BQ17RB0 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RTL8BQ17RB0 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RTL8BQ17RB0 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RTL8BQ17RB0 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RTL8BQ17RB0 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RTL8BQ17RB0 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RTL8BQ17RB0 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RTL8BQ17RB0 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RTL8BQ17RB0 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RTL8BQ17RB0 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RTL8BQ17RB0 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RTL8BQ17RB0 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RTL8BQ17RB0 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
RTL8BQ17RB0 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RTL8BQ17RB0 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RTL8BQ17RB0 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RTL8BQ17RB0 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RTL8BQ17RB0 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RTL8BQ17RB0 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RTL8BQ17RB0 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RTL8BQ17RB0 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RTL8BQ17RB0 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RTL8BQ17RB0 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RTL8BQ17RB0 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RTL8BQ17RB0 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RTL8BQ17RB0 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RTL8BQ17RB0 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
RTL8BQ17RB0 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RTL8BQ17RB0 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RTL8BQ17RB0 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RTL8BQ17RB0 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RTL8BQ17RB0 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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RTL8BQ17RB0 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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RTL8BQ17RB0 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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RTL8BQ17RB0 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RTL8BQ17RB0 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RTL8BQ17RB0 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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RTL8BQ17RB0 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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RTL8BQ17RB0 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
RTL8BQ17RB0 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
RTL8BQ17RB0 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RTL8BQ17RB0 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RTL8BQ17RB0 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
RTL8BQ17RB0 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
RTL8BQ17RB0 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
RTL8BQ17RB0 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RTL8BQ17RB0 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RTL8BQ17RB0 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RTL8BQ17RB0 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RTL8BQ17RB0 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RTL8BQ17RB0 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RTL8BQ17RB0 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RTL8BQ17RB0 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RTL8BQ17RB0 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RTL8BQ17RB0 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RTL8BQ17RB0 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RTL8BQ17RB0 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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