Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

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Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDKN3Q16667 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDKN3Q16667 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDKN3Q16667 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDKN3Q16667 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDKN3Q16667 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDKN3Q16667 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDKN3Q16667 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDKN3Q16667 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDKN3Q16667 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDKN3Q16667 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDKN3Q16667 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDKN3Q16667 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDKN3Q16667 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDKN3Q16667 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CDKN3Q16667 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDKN3Q16667 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDKN3Q16667 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDKN3Q16667 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDKN3Q16667 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDKN3Q16667 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CDKN3Q16667 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDKN3Q16667 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDKN3Q16667 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDKN3Q16667 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDKN3Q16667 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDKN3Q16667 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDKN3Q16667 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDKN3Q16667 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDKN3Q16667 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDKN3Q16667 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CDKN3Q16667 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CDKN3Q16667 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CDKN3Q16667 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDKN3Q16667 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CDKN3Q16667 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CDKN3Q16667 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDKN3Q16667 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDKN3Q16667 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDKN3Q16667 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDKN3Q16667 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDKN3Q16667 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDKN3Q16667 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDKN3Q16667 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDKN3Q16667 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDKN3Q16667 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDKN3Q16667 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDKN3Q16667 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDKN3Q16667 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDKN3Q16667 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDKN3Q16667 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDKN3Q16667 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDKN3Q16667 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDKN3Q16667 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDKN3Q16667 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDKN3Q16667 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDKN3Q16667 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDKN3Q16667 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDKN3Q16667 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDKN3Q16667 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDKN3Q16667 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDKN3Q16667 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDKN3Q16667 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDKN3Q16667 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDKN3Q16667 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDKN3Q16667 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CDKN3Q16667 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CDKN3Q16667 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDKN3Q16667 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDKN3Q16667 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CDKN3Q16667 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDKN3Q16667 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CDKN3Q16667 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDKN3Q16667 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDKN3Q16667 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDKN3Q16667 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDKN3Q16667 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDKN3Q16667 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDKN3Q16667 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDKN3Q16667 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDKN3Q16667 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDKN3Q16667 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDKN3Q16667 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDKN3Q16667 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDKN3Q16667 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDKN3Q16667 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDKN3Q16667 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDKN3Q16667 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDKN3Q16667 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDKN3Q16667 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDKN3Q16667 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDKN3Q16667 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDKN3Q16667 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDKN3Q16667 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDKN3Q16667 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDKN3Q16667 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CDKN3Q16667 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CDKN3Q16667 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDKN3Q16667 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDKN3Q16667 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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