Protein–RNA interactions for Protein: Q15628

TRADD, Tumor necrosis factor receptor type 1-associated DEATH domain protein, humanhuman

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Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRADDQ15628 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TRADDQ15628 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TRADDQ15628 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TRADDQ15628 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
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