Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
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PDCD1Q15116 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PDCD1Q15116 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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