Protein–RNA interactions for Protein: Q14623

IHH, Indian hedgehog protein, humanhuman

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Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IHHQ14623 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IHHQ14623 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IHHQ14623 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IHHQ14623 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IHHQ14623 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IHHQ14623 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IHHQ14623 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IHHQ14623 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IHHQ14623 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IHHQ14623 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IHHQ14623 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IHHQ14623 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IHHQ14623 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IHHQ14623 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IHHQ14623 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IHHQ14623 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IHHQ14623 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IHHQ14623 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IHHQ14623 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IHHQ14623 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IHHQ14623 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IHHQ14623 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IHHQ14623 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IHHQ14623 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
IHHQ14623 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
IHHQ14623 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IHHQ14623 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IHHQ14623 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
IHHQ14623 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
IHHQ14623 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
IHHQ14623 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
IHHQ14623 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
IHHQ14623 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
IHHQ14623 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
IHHQ14623 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
IHHQ14623 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
IHHQ14623 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
IHHQ14623 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
IHHQ14623 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
IHHQ14623 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IHHQ14623 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IHHQ14623 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IHHQ14623 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IHHQ14623 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IHHQ14623 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IHHQ14623 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IHHQ14623 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IHHQ14623 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IHHQ14623 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IHHQ14623 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IHHQ14623 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IHHQ14623 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IHHQ14623 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IHHQ14623 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IHHQ14623 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IHHQ14623 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IHHQ14623 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IHHQ14623 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IHHQ14623 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
IHHQ14623 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IHHQ14623 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
IHHQ14623 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
IHHQ14623 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IHHQ14623 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IHHQ14623 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IHHQ14623 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IHHQ14623 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IHHQ14623 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IHHQ14623 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
IHHQ14623 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IHHQ14623 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IHHQ14623 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IHHQ14623 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IHHQ14623 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IHHQ14623 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IHHQ14623 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IHHQ14623 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IHHQ14623 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IHHQ14623 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IHHQ14623 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IHHQ14623 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IHHQ14623 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IHHQ14623 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IHHQ14623 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IHHQ14623 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC16■□□□□ 0.15
IHHQ14623 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
IHHQ14623 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
IHHQ14623 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16■□□□□ 0.15
IHHQ14623 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
IHHQ14623 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
IHHQ14623 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IHHQ14623 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IHHQ14623 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IHHQ14623 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IHHQ14623 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IHHQ14623 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
IHHQ14623 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IHHQ14623 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
IHHQ14623 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
IHHQ14623 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms