Protein–RNA interactions for Protein: Q14247

CTTN, Src substrate cortactin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNQ14247 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTTNQ14247 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTTNQ14247 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CTTNQ14247 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTTNQ14247 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTTNQ14247 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTTNQ14247 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTTNQ14247 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTTNQ14247 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTTNQ14247 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTTNQ14247 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTTNQ14247 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTTNQ14247 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTTNQ14247 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTTNQ14247 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTTNQ14247 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CTTNQ14247 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
CTTNQ14247 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CTTNQ14247 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CTTNQ14247 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CTTNQ14247 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CTTNQ14247 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CTTNQ14247 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CTTNQ14247 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CTTNQ14247 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CTTNQ14247 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CTTNQ14247 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CTTNQ14247 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTTNQ14247 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTTNQ14247 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTTNQ14247 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTTNQ14247 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTTNQ14247 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CTTNQ14247 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTTNQ14247 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTTNQ14247 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CTTNQ14247 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTTNQ14247 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTTNQ14247 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CTTNQ14247 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTTNQ14247 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTTNQ14247 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTTNQ14247 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTTNQ14247 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTTNQ14247 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTTNQ14247 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTTNQ14247 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTTNQ14247 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTTNQ14247 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTTNQ14247 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTTNQ14247 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTTNQ14247 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTTNQ14247 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTTNQ14247 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTTNQ14247 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTTNQ14247 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTTNQ14247 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTTNQ14247 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTTNQ14247 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTTNQ14247 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTTNQ14247 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTTNQ14247 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTTNQ14247 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTTNQ14247 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTTNQ14247 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTTNQ14247 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTTNQ14247 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTTNQ14247 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTTNQ14247 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTTNQ14247 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTTNQ14247 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTTNQ14247 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTTNQ14247 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTTNQ14247 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTTNQ14247 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CTTNQ14247 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTTNQ14247 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTTNQ14247 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTTNQ14247 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTTNQ14247 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTTNQ14247 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTTNQ14247 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTTNQ14247 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTTNQ14247 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTTNQ14247 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTTNQ14247 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTTNQ14247 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTTNQ14247 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTTNQ14247 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTTNQ14247 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTTNQ14247 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTTNQ14247 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTTNQ14247 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTTNQ14247 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTTNQ14247 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTTNQ14247 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTTNQ14247 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTTNQ14247 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTTNQ14247 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTTNQ14247 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms