Protein–RNA interactions for Protein: Q14213

EBI3, Interleukin-27 subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBI3Q14213 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
EBI3Q14213 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
EBI3Q14213 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
EBI3Q14213 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
EBI3Q14213 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
EBI3Q14213 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
EBI3Q14213 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
EBI3Q14213 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
EBI3Q14213 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
EBI3Q14213 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
EBI3Q14213 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
EBI3Q14213 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
EBI3Q14213 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
EBI3Q14213 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
EBI3Q14213 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
EBI3Q14213 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
EBI3Q14213 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
EBI3Q14213 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
EBI3Q14213 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
EBI3Q14213 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC12.64□□□□□ -0.39
EBI3Q14213 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
EBI3Q14213 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
EBI3Q14213 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
EBI3Q14213 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
EBI3Q14213 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
EBI3Q14213 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
EBI3Q14213 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
EBI3Q14213 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
EBI3Q14213 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
EBI3Q14213 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
EBI3Q14213 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
EBI3Q14213 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
EBI3Q14213 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
EBI3Q14213 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
EBI3Q14213 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
EBI3Q14213 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
EBI3Q14213 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
EBI3Q14213 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
EBI3Q14213 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
EBI3Q14213 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
EBI3Q14213 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
EBI3Q14213 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
EBI3Q14213 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
EBI3Q14213 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
EBI3Q14213 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
EBI3Q14213 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
EBI3Q14213 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
EBI3Q14213 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
EBI3Q14213 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
EBI3Q14213 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
EBI3Q14213 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
EBI3Q14213 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
EBI3Q14213 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
EBI3Q14213 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
EBI3Q14213 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
EBI3Q14213 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
EBI3Q14213 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
EBI3Q14213 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
EBI3Q14213 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
EBI3Q14213 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
EBI3Q14213 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
EBI3Q14213 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
EBI3Q14213 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
EBI3Q14213 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
EBI3Q14213 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
EBI3Q14213 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
EBI3Q14213 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
EBI3Q14213 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
EBI3Q14213 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
EBI3Q14213 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
EBI3Q14213 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
EBI3Q14213 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
EBI3Q14213 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
EBI3Q14213 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
EBI3Q14213 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
EBI3Q14213 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
EBI3Q14213 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
EBI3Q14213 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
EBI3Q14213 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
EBI3Q14213 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
EBI3Q14213 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
EBI3Q14213 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
EBI3Q14213 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
EBI3Q14213 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
EBI3Q14213 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
EBI3Q14213 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
EBI3Q14213 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
EBI3Q14213 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
EBI3Q14213 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
EBI3Q14213 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
EBI3Q14213 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
EBI3Q14213 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
EBI3Q14213 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
EBI3Q14213 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
EBI3Q14213 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
EBI3Q14213 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
EBI3Q14213 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
EBI3Q14213 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
EBI3Q14213 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
EBI3Q14213 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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