Protein–RNA interactions for Protein: Q13670

PMS2P11, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P11Q13670 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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PMS2P11Q13670 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
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PMS2P11Q13670 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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PMS2P11Q13670 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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PMS2P11Q13670 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
PMS2P11Q13670 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.35
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PMS2P11Q13670 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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PMS2P11Q13670 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PMS2P11Q13670 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PMS2P11Q13670 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
PMS2P11Q13670 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
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PMS2P11Q13670 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PMS2P11Q13670 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PMS2P11Q13670 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PMS2P11Q13670 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PMS2P11Q13670 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PMS2P11Q13670 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PMS2P11Q13670 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PMS2P11Q13670 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PMS2P11Q13670 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
PMS2P11Q13670 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PMS2P11Q13670 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PMS2P11Q13670 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PMS2P11Q13670 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PMS2P11Q13670 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PMS2P11Q13670 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
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