Protein–RNA interactions for Protein: Q13564

NAE1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAE1Q13564 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NAE1Q13564 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NAE1Q13564 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NAE1Q13564 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NAE1Q13564 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NAE1Q13564 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NAE1Q13564 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NAE1Q13564 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NAE1Q13564 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NAE1Q13564 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NAE1Q13564 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NAE1Q13564 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NAE1Q13564 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NAE1Q13564 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NAE1Q13564 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NAE1Q13564 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NAE1Q13564 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NAE1Q13564 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NAE1Q13564 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NAE1Q13564 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NAE1Q13564 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NAE1Q13564 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NAE1Q13564 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NAE1Q13564 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NAE1Q13564 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NAE1Q13564 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NAE1Q13564 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NAE1Q13564 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NAE1Q13564 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NAE1Q13564 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NAE1Q13564 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NAE1Q13564 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NAE1Q13564 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NAE1Q13564 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NAE1Q13564 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NAE1Q13564 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NAE1Q13564 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NAE1Q13564 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NAE1Q13564 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
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NAE1Q13564 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NAE1Q13564 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NAE1Q13564 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NAE1Q13564 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NAE1Q13564 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NAE1Q13564 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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NAE1Q13564 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NAE1Q13564 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
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NAE1Q13564 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NAE1Q13564 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NAE1Q13564 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NAE1Q13564 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
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NAE1Q13564 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NAE1Q13564 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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NAE1Q13564 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NAE1Q13564 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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NAE1Q13564 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
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NAE1Q13564 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NAE1Q13564 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NAE1Q13564 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NAE1Q13564 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NAE1Q13564 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NAE1Q13564 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NAE1Q13564 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NAE1Q13564 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NAE1Q13564 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NAE1Q13564 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NAE1Q13564 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NAE1Q13564 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NAE1Q13564 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NAE1Q13564 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NAE1Q13564 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NAE1Q13564 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NAE1Q13564 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NAE1Q13564 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NAE1Q13564 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NAE1Q13564 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NAE1Q13564 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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