Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPA4Q13156 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPA4Q13156 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPA4Q13156 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RPA4Q13156 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPA4Q13156 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPA4Q13156 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RPA4Q13156 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPA4Q13156 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPA4Q13156 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RPA4Q13156 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RPA4Q13156 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPA4Q13156 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPA4Q13156 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPA4Q13156 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPA4Q13156 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPA4Q13156 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPA4Q13156 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPA4Q13156 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPA4Q13156 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPA4Q13156 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPA4Q13156 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPA4Q13156 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPA4Q13156 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPA4Q13156 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPA4Q13156 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPA4Q13156 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPA4Q13156 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPA4Q13156 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPA4Q13156 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPA4Q13156 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPA4Q13156 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RPA4Q13156 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPA4Q13156 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPA4Q13156 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPA4Q13156 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPA4Q13156 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPA4Q13156 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPA4Q13156 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPA4Q13156 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPA4Q13156 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPA4Q13156 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPA4Q13156 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPA4Q13156 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPA4Q13156 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPA4Q13156 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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RPA4Q13156 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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RPA4Q13156 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPA4Q13156 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPA4Q13156 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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RPA4Q13156 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPA4Q13156 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPA4Q13156 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPA4Q13156 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPA4Q13156 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPA4Q13156 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPA4Q13156 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPA4Q13156 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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RPA4Q13156 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPA4Q13156 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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RPA4Q13156 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPA4Q13156 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPA4Q13156 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPA4Q13156 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPA4Q13156 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPA4Q13156 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPA4Q13156 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPA4Q13156 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPA4Q13156 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPA4Q13156 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPA4Q13156 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPA4Q13156 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPA4Q13156 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPA4Q13156 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPA4Q13156 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPA4Q13156 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPA4Q13156 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPA4Q13156 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPA4Q13156 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPA4Q13156 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPA4Q13156 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPA4Q13156 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPA4Q13156 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPA4Q13156 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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