Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MKRN3Q13064 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MKRN3Q13064 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MKRN3Q13064 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MKRN3Q13064 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MKRN3Q13064 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MKRN3Q13064 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MKRN3Q13064 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MKRN3Q13064 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MKRN3Q13064 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MKRN3Q13064 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MKRN3Q13064 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MKRN3Q13064 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MKRN3Q13064 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MKRN3Q13064 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
MKRN3Q13064 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MKRN3Q13064 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MKRN3Q13064 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
MKRN3Q13064 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
MKRN3Q13064 AL136370.1-201ENST00000608166 691 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
MKRN3Q13064 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
MKRN3Q13064 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MKRN3Q13064 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MKRN3Q13064 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MKRN3Q13064 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MKRN3Q13064 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MKRN3Q13064 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MKRN3Q13064 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MKRN3Q13064 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MKRN3Q13064 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
MKRN3Q13064 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MKRN3Q13064 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MKRN3Q13064 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MKRN3Q13064 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MKRN3Q13064 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MKRN3Q13064 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MKRN3Q13064 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MKRN3Q13064 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MKRN3Q13064 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MKRN3Q13064 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MKRN3Q13064 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MKRN3Q13064 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MKRN3Q13064 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MKRN3Q13064 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MKRN3Q13064 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MKRN3Q13064 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MKRN3Q13064 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MKRN3Q13064 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MKRN3Q13064 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MKRN3Q13064 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MKRN3Q13064 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MKRN3Q13064 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
MKRN3Q13064 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MKRN3Q13064 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MKRN3Q13064 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MKRN3Q13064 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MKRN3Q13064 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MKRN3Q13064 AP002336.2-201ENST00000528607 539 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MKRN3Q13064 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MKRN3Q13064 EMC4-208ENST00000559078 599 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MKRN3Q13064 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MKRN3Q13064 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
MKRN3Q13064 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
MKRN3Q13064 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MKRN3Q13064 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
MKRN3Q13064 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
MKRN3Q13064 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MKRN3Q13064 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MKRN3Q13064 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
MKRN3Q13064 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MKRN3Q13064 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MKRN3Q13064 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MKRN3Q13064 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MKRN3Q13064 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MKRN3Q13064 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MKRN3Q13064 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MKRN3Q13064 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MKRN3Q13064 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MKRN3Q13064 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MKRN3Q13064 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MKRN3Q13064 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MKRN3Q13064 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MKRN3Q13064 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MKRN3Q13064 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MKRN3Q13064 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MKRN3Q13064 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MKRN3Q13064 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MKRN3Q13064 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MKRN3Q13064 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MKRN3Q13064 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MKRN3Q13064 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MKRN3Q13064 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MKRN3Q13064 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MKRN3Q13064 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MKRN3Q13064 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MKRN3Q13064 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MKRN3Q13064 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
MKRN3Q13064 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MKRN3Q13064 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MKRN3Q13064 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
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