Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GRIK3Q13003 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GRIK3Q13003 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GRIK3Q13003 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GRIK3Q13003 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GRIK3Q13003 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GRIK3Q13003 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GRIK3Q13003 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GRIK3Q13003 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GRIK3Q13003 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GRIK3Q13003 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GRIK3Q13003 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
GRIK3Q13003 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GRIK3Q13003 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GRIK3Q13003 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GRIK3Q13003 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GRIK3Q13003 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GRIK3Q13003 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GRIK3Q13003 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GRIK3Q13003 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GRIK3Q13003 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GRIK3Q13003 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GRIK3Q13003 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
GRIK3Q13003 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GRIK3Q13003 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GRIK3Q13003 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GRIK3Q13003 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
GRIK3Q13003 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GRIK3Q13003 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GRIK3Q13003 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GRIK3Q13003 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GRIK3Q13003 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GRIK3Q13003 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
GRIK3Q13003 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GRIK3Q13003 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GRIK3Q13003 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GRIK3Q13003 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GRIK3Q13003 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GRIK3Q13003 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
GRIK3Q13003 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GRIK3Q13003 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GRIK3Q13003 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GRIK3Q13003 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GRIK3Q13003 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GRIK3Q13003 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GRIK3Q13003 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GRIK3Q13003 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GRIK3Q13003 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GRIK3Q13003 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GRIK3Q13003 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GRIK3Q13003 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GRIK3Q13003 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GRIK3Q13003 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GRIK3Q13003 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
GRIK3Q13003 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
GRIK3Q13003 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
GRIK3Q13003 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GRIK3Q13003 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GRIK3Q13003 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GRIK3Q13003 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GRIK3Q13003 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GRIK3Q13003 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GRIK3Q13003 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GRIK3Q13003 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GRIK3Q13003 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GRIK3Q13003 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GRIK3Q13003 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
GRIK3Q13003 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
GRIK3Q13003 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
GRIK3Q13003 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GRIK3Q13003 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GRIK3Q13003 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GRIK3Q13003 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
GRIK3Q13003 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
GRIK3Q13003 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
GRIK3Q13003 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GRIK3Q13003 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
GRIK3Q13003 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GRIK3Q13003 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GRIK3Q13003 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
GRIK3Q13003 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GRIK3Q13003 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GRIK3Q13003 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GRIK3Q13003 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GRIK3Q13003 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
GRIK3Q13003 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
GRIK3Q13003 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
GRIK3Q13003 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GRIK3Q13003 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GRIK3Q13003 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GRIK3Q13003 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GRIK3Q13003 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GRIK3Q13003 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
GRIK3Q13003 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GRIK3Q13003 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GRIK3Q13003 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GRIK3Q13003 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GRIK3Q13003 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GRIK3Q13003 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
GRIK3Q13003 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
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