Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GRIK2Q13002 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GRIK2Q13002 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GRIK2Q13002 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GRIK2Q13002 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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