Protein–RNA interactions for Protein: Q12809

KCNH2, Potassium voltage-gated channel subfamily H member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNH2Q12809 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KCNH2Q12809 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KCNH2Q12809 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KCNH2Q12809 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KCNH2Q12809 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KCNH2Q12809 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
KCNH2Q12809 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KCNH2Q12809 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KCNH2Q12809 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
KCNH2Q12809 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KCNH2Q12809 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KCNH2Q12809 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KCNH2Q12809 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KCNH2Q12809 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KCNH2Q12809 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KCNH2Q12809 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KCNH2Q12809 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KCNH2Q12809 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNH2Q12809 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNH2Q12809 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNH2Q12809 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNH2Q12809 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNH2Q12809 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNH2Q12809 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNH2Q12809 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNH2Q12809 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNH2Q12809 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNH2Q12809 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNH2Q12809 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNH2Q12809 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNH2Q12809 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNH2Q12809 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNH2Q12809 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNH2Q12809 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNH2Q12809 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNH2Q12809 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNH2Q12809 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNH2Q12809 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNH2Q12809 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNH2Q12809 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNH2Q12809 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNH2Q12809 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNH2Q12809 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNH2Q12809 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNH2Q12809 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNH2Q12809 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNH2Q12809 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNH2Q12809 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNH2Q12809 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNH2Q12809 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNH2Q12809 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNH2Q12809 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNH2Q12809 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNH2Q12809 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNH2Q12809 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNH2Q12809 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNH2Q12809 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNH2Q12809 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNH2Q12809 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNH2Q12809 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNH2Q12809 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNH2Q12809 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNH2Q12809 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNH2Q12809 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNH2Q12809 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNH2Q12809 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNH2Q12809 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNH2Q12809 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNH2Q12809 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNH2Q12809 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNH2Q12809 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNH2Q12809 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNH2Q12809 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNH2Q12809 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNH2Q12809 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNH2Q12809 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNH2Q12809 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNH2Q12809 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNH2Q12809 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNH2Q12809 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNH2Q12809 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNH2Q12809 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNH2Q12809 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNH2Q12809 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNH2Q12809 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNH2Q12809 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNH2Q12809 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNH2Q12809 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNH2Q12809 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNH2Q12809 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNH2Q12809 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNH2Q12809 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNH2Q12809 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNH2Q12809 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNH2Q12809 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNH2Q12809 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNH2Q12809 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNH2Q12809 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNH2Q12809 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNH2Q12809 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms