Protein–RNA interactions for Protein: Q12772

SREBF2, Sterol regulatory element-binding protein 2, humanhuman

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Length 1,141 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF2Q12772 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SREBF2Q12772 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SREBF2Q12772 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SREBF2Q12772 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SREBF2Q12772 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SREBF2Q12772 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SREBF2Q12772 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SREBF2Q12772 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SREBF2Q12772 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SREBF2Q12772 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SREBF2Q12772 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SREBF2Q12772 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SREBF2Q12772 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SREBF2Q12772 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SREBF2Q12772 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SREBF2Q12772 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SREBF2Q12772 AC020763.1-201ENST00000567186 551 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SREBF2Q12772 AP000894.2-204ENST00000577358 473 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SREBF2Q12772 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SREBF2Q12772 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SREBF2Q12772 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SREBF2Q12772 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SREBF2Q12772 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SREBF2Q12772 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SREBF2Q12772 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SREBF2Q12772 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SREBF2Q12772 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SREBF2Q12772 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SREBF2Q12772 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SREBF2Q12772 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SREBF2Q12772 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SREBF2Q12772 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SREBF2Q12772 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SREBF2Q12772 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SREBF2Q12772 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SREBF2Q12772 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SREBF2Q12772 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SREBF2Q12772 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SREBF2Q12772 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SREBF2Q12772 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SREBF2Q12772 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SREBF2Q12772 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SREBF2Q12772 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SREBF2Q12772 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SREBF2Q12772 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SREBF2Q12772 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SREBF2Q12772 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SREBF2Q12772 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SREBF2Q12772 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SREBF2Q12772 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SREBF2Q12772 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SREBF2Q12772 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SREBF2Q12772 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SREBF2Q12772 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SREBF2Q12772 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SREBF2Q12772 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SREBF2Q12772 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SREBF2Q12772 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SREBF2Q12772 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SREBF2Q12772 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SREBF2Q12772 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SREBF2Q12772 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SREBF2Q12772 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SREBF2Q12772 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SREBF2Q12772 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SREBF2Q12772 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SREBF2Q12772 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SREBF2Q12772 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SREBF2Q12772 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SREBF2Q12772 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SREBF2Q12772 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SREBF2Q12772 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SREBF2Q12772 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SREBF2Q12772 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SREBF2Q12772 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SREBF2Q12772 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SREBF2Q12772 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SREBF2Q12772 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SREBF2Q12772 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SREBF2Q12772 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SREBF2Q12772 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SREBF2Q12772 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SREBF2Q12772 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SREBF2Q12772 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SREBF2Q12772 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SREBF2Q12772 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SREBF2Q12772 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SREBF2Q12772 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SREBF2Q12772 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SREBF2Q12772 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SREBF2Q12772 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SREBF2Q12772 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SREBF2Q12772 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SREBF2Q12772 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SREBF2Q12772 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SREBF2Q12772 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SREBF2Q12772 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SREBF2Q12772 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SREBF2Q12772 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SREBF2Q12772 MIR4750-201ENST00000584564 56 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
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