Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K3

RIPPLY1, Protein ripply1, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY1Q0D2K3 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
RIPPLY1Q0D2K3 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
RIPPLY1Q0D2K3 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
RIPPLY1Q0D2K3 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
RIPPLY1Q0D2K3 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
RIPPLY1Q0D2K3 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
RIPPLY1Q0D2K3 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
RIPPLY1Q0D2K3 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
RIPPLY1Q0D2K3 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
RIPPLY1Q0D2K3 IFRD1-205ENST00000429071 1938 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
RIPPLY1Q0D2K3 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
RIPPLY1Q0D2K3 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
RIPPLY1Q0D2K3 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
RIPPLY1Q0D2K3 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
RIPPLY1Q0D2K3 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
RIPPLY1Q0D2K3 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.16□□□□□ -0.14
RIPPLY1Q0D2K3 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
RIPPLY1Q0D2K3 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC14.16□□□□□ -0.14
RIPPLY1Q0D2K3 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
RIPPLY1Q0D2K3 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
RIPPLY1Q0D2K3 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC14.16□□□□□ -0.14
RIPPLY1Q0D2K3 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
RIPPLY1Q0D2K3 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
RIPPLY1Q0D2K3 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
RIPPLY1Q0D2K3 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
RIPPLY1Q0D2K3 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
RIPPLY1Q0D2K3 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
RIPPLY1Q0D2K3 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
RIPPLY1Q0D2K3 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
RIPPLY1Q0D2K3 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
RIPPLY1Q0D2K3 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
RIPPLY1Q0D2K3 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
RIPPLY1Q0D2K3 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
RIPPLY1Q0D2K3 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
RIPPLY1Q0D2K3 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
RIPPLY1Q0D2K3 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
RIPPLY1Q0D2K3 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
RIPPLY1Q0D2K3 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
RIPPLY1Q0D2K3 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
RIPPLY1Q0D2K3 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
RIPPLY1Q0D2K3 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
RIPPLY1Q0D2K3 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
RIPPLY1Q0D2K3 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
RIPPLY1Q0D2K3 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC14.15□□□□□ -0.14
RIPPLY1Q0D2K3 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
RIPPLY1Q0D2K3 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
RIPPLY1Q0D2K3 SIPA1L3-201ENST00000222345 7987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
RIPPLY1Q0D2K3 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
RIPPLY1Q0D2K3 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
RIPPLY1Q0D2K3 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
RIPPLY1Q0D2K3 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
RIPPLY1Q0D2K3 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
RIPPLY1Q0D2K3 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
RIPPLY1Q0D2K3 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
RIPPLY1Q0D2K3 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
RIPPLY1Q0D2K3 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
RIPPLY1Q0D2K3 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
RIPPLY1Q0D2K3 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
RIPPLY1Q0D2K3 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
RIPPLY1Q0D2K3 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
RIPPLY1Q0D2K3 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
RIPPLY1Q0D2K3 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
RIPPLY1Q0D2K3 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
RIPPLY1Q0D2K3 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
RIPPLY1Q0D2K3 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
RIPPLY1Q0D2K3 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
RIPPLY1Q0D2K3 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
RIPPLY1Q0D2K3 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
RIPPLY1Q0D2K3 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
RIPPLY1Q0D2K3 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC14.15□□□□□ -0.14
RIPPLY1Q0D2K3 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
RIPPLY1Q0D2K3 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
RIPPLY1Q0D2K3 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
RIPPLY1Q0D2K3 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
RIPPLY1Q0D2K3 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
RIPPLY1Q0D2K3 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
RIPPLY1Q0D2K3 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
RIPPLY1Q0D2K3 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
RIPPLY1Q0D2K3 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
RIPPLY1Q0D2K3 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
RIPPLY1Q0D2K3 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
RIPPLY1Q0D2K3 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
RIPPLY1Q0D2K3 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
RIPPLY1Q0D2K3 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
RIPPLY1Q0D2K3 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
RIPPLY1Q0D2K3 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
RIPPLY1Q0D2K3 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
RIPPLY1Q0D2K3 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
RIPPLY1Q0D2K3 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
RIPPLY1Q0D2K3 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
RIPPLY1Q0D2K3 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
RIPPLY1Q0D2K3 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
RIPPLY1Q0D2K3 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC14.15□□□□□ -0.15
RIPPLY1Q0D2K3 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
RIPPLY1Q0D2K3 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
RIPPLY1Q0D2K3 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
RIPPLY1Q0D2K3 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
RIPPLY1Q0D2K3 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
RIPPLY1Q0D2K3 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
RIPPLY1Q0D2K3 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.8 ms